Protein–RNA interactions for Protein: Q02318

CYP27A1, Sterol 26-hydroxylase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 531 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYP27A1Q02318 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CYP27A1Q02318 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CYP27A1Q02318 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CYP27A1Q02318 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
CYP27A1Q02318 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CYP27A1Q02318 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CYP27A1Q02318 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CYP27A1Q02318 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CYP27A1Q02318 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CYP27A1Q02318 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.02
CYP27A1Q02318 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
CYP27A1Q02318 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC21.39■■□□□ 1.02
CYP27A1Q02318 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
CYP27A1Q02318 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
CYP27A1Q02318 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CYP27A1Q02318 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CYP27A1Q02318 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CYP27A1Q02318 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
CYP27A1Q02318 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
CYP27A1Q02318 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CYP27A1Q02318 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CYP27A1Q02318 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CYP27A1Q02318 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
CYP27A1Q02318 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CYP27A1Q02318 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CYP27A1Q02318 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CYP27A1Q02318 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CYP27A1Q02318 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CYP27A1Q02318 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CYP27A1Q02318 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CYP27A1Q02318 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CYP27A1Q02318 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CYP27A1Q02318 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CYP27A1Q02318 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CYP27A1Q02318 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CYP27A1Q02318 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CYP27A1Q02318 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CYP27A1Q02318 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CYP27A1Q02318 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
CYP27A1Q02318 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CYP27A1Q02318 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CYP27A1Q02318 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CYP27A1Q02318 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CYP27A1Q02318 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CYP27A1Q02318 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CYP27A1Q02318 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CYP27A1Q02318 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CYP27A1Q02318 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CYP27A1Q02318 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CYP27A1Q02318 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CYP27A1Q02318 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CYP27A1Q02318 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CYP27A1Q02318 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CYP27A1Q02318 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CYP27A1Q02318 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CYP27A1Q02318 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CYP27A1Q02318 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CYP27A1Q02318 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CYP27A1Q02318 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CYP27A1Q02318 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CYP27A1Q02318 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CYP27A1Q02318 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CYP27A1Q02318 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CYP27A1Q02318 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CYP27A1Q02318 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CYP27A1Q02318 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CYP27A1Q02318 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
CYP27A1Q02318 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CYP27A1Q02318 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CYP27A1Q02318 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CYP27A1Q02318 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CYP27A1Q02318 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CYP27A1Q02318 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CYP27A1Q02318 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CYP27A1Q02318 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CYP27A1Q02318 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CYP27A1Q02318 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CYP27A1Q02318 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CYP27A1Q02318 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CYP27A1Q02318 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CYP27A1Q02318 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CYP27A1Q02318 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CYP27A1Q02318 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CYP27A1Q02318 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CYP27A1Q02318 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CYP27A1Q02318 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CYP27A1Q02318 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CYP27A1Q02318 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
CYP27A1Q02318 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CYP27A1Q02318 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CYP27A1Q02318 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CYP27A1Q02318 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CYP27A1Q02318 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CYP27A1Q02318 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
CYP27A1Q02318 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CYP27A1Q02318 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CYP27A1Q02318 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CYP27A1Q02318 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CYP27A1Q02318 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CYP27A1Q02318 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.7 ms