Protein–RNA interactions for Protein: Q01892

SPIB, Transcription factor Spi-B, humanhuman

Predictions only

Length 262 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPIBQ01892 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SPIBQ01892 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SPIBQ01892 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SPIBQ01892 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SPIBQ01892 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SPIBQ01892 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SPIBQ01892 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SPIBQ01892 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SPIBQ01892 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SPIBQ01892 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SPIBQ01892 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SPIBQ01892 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SPIBQ01892 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SPIBQ01892 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SPIBQ01892 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SPIBQ01892 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SPIBQ01892 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SPIBQ01892 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SPIBQ01892 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SPIBQ01892 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SPIBQ01892 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SPIBQ01892 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
SPIBQ01892 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SPIBQ01892 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SPIBQ01892 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SPIBQ01892 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SPIBQ01892 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SPIBQ01892 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SPIBQ01892 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SPIBQ01892 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
SPIBQ01892 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SPIBQ01892 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SPIBQ01892 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SPIBQ01892 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SPIBQ01892 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SPIBQ01892 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SPIBQ01892 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
SPIBQ01892 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
SPIBQ01892 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
SPIBQ01892 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SPIBQ01892 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SPIBQ01892 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SPIBQ01892 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SPIBQ01892 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SPIBQ01892 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SPIBQ01892 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SPIBQ01892 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SPIBQ01892 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SPIBQ01892 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SPIBQ01892 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SPIBQ01892 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SPIBQ01892 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SPIBQ01892 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SPIBQ01892 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SPIBQ01892 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SPIBQ01892 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SPIBQ01892 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SPIBQ01892 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SPIBQ01892 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SPIBQ01892 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SPIBQ01892 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SPIBQ01892 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SPIBQ01892 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SPIBQ01892 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SPIBQ01892 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SPIBQ01892 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SPIBQ01892 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SPIBQ01892 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SPIBQ01892 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SPIBQ01892 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
SPIBQ01892 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SPIBQ01892 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SPIBQ01892 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SPIBQ01892 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SPIBQ01892 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
SPIBQ01892 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SPIBQ01892 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SPIBQ01892 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SPIBQ01892 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SPIBQ01892 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SPIBQ01892 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SPIBQ01892 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SPIBQ01892 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SPIBQ01892 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SPIBQ01892 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SPIBQ01892 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SPIBQ01892 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SPIBQ01892 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SPIBQ01892 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SPIBQ01892 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SPIBQ01892 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SPIBQ01892 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SPIBQ01892 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SPIBQ01892 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SPIBQ01892 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SPIBQ01892 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SPIBQ01892 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SPIBQ01892 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SPIBQ01892 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SPIBQ01892 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.2 ms