Protein–RNA interactions for Protein: Q01804

OTUD4, OTU domain-containing protein 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,114 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OTUD4Q01804 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
OTUD4Q01804 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
OTUD4Q01804 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
OTUD4Q01804 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
OTUD4Q01804 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
OTUD4Q01804 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
OTUD4Q01804 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
OTUD4Q01804 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
OTUD4Q01804 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
OTUD4Q01804 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
OTUD4Q01804 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
OTUD4Q01804 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
OTUD4Q01804 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
OTUD4Q01804 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
OTUD4Q01804 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
OTUD4Q01804 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
OTUD4Q01804 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
OTUD4Q01804 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
OTUD4Q01804 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
OTUD4Q01804 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
OTUD4Q01804 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
OTUD4Q01804 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
OTUD4Q01804 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
OTUD4Q01804 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
OTUD4Q01804 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
OTUD4Q01804 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
OTUD4Q01804 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
OTUD4Q01804 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
OTUD4Q01804 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
OTUD4Q01804 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
OTUD4Q01804 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
OTUD4Q01804 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
OTUD4Q01804 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
OTUD4Q01804 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
OTUD4Q01804 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
OTUD4Q01804 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
OTUD4Q01804 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
OTUD4Q01804 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
OTUD4Q01804 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
OTUD4Q01804 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
OTUD4Q01804 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
OTUD4Q01804 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
OTUD4Q01804 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
OTUD4Q01804 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
OTUD4Q01804 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
OTUD4Q01804 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
OTUD4Q01804 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
OTUD4Q01804 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
OTUD4Q01804 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
OTUD4Q01804 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
OTUD4Q01804 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
OTUD4Q01804 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
OTUD4Q01804 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
OTUD4Q01804 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
OTUD4Q01804 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
OTUD4Q01804 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
OTUD4Q01804 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
OTUD4Q01804 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
OTUD4Q01804 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
OTUD4Q01804 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
OTUD4Q01804 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
OTUD4Q01804 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
OTUD4Q01804 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
OTUD4Q01804 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
OTUD4Q01804 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
OTUD4Q01804 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
OTUD4Q01804 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
OTUD4Q01804 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
OTUD4Q01804 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
OTUD4Q01804 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
OTUD4Q01804 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
OTUD4Q01804 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
OTUD4Q01804 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
OTUD4Q01804 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
OTUD4Q01804 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
OTUD4Q01804 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
OTUD4Q01804 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
OTUD4Q01804 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
OTUD4Q01804 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
OTUD4Q01804 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
OTUD4Q01804 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC20.19■□□□□ 0.82
OTUD4Q01804 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
OTUD4Q01804 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
OTUD4Q01804 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
OTUD4Q01804 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
OTUD4Q01804 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
OTUD4Q01804 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
OTUD4Q01804 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
OTUD4Q01804 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
OTUD4Q01804 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
OTUD4Q01804 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
OTUD4Q01804 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
OTUD4Q01804 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
OTUD4Q01804 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
OTUD4Q01804 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
OTUD4Q01804 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
OTUD4Q01804 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
OTUD4Q01804 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
OTUD4Q01804 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
OTUD4Q01804 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38 ms