Protein–RNA interactions for Protein: Q00887

PSG9, Pregnancy-specific beta-1-glycoprotein 9, humanhuman

Predictions only

Length 426 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSG9Q00887 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PSG9Q00887 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PSG9Q00887 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PSG9Q00887 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PSG9Q00887 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PSG9Q00887 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PSG9Q00887 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PSG9Q00887 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PSG9Q00887 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PSG9Q00887 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PSG9Q00887 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PSG9Q00887 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PSG9Q00887 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PSG9Q00887 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PSG9Q00887 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PSG9Q00887 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PSG9Q00887 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PSG9Q00887 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PSG9Q00887 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
PSG9Q00887 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PSG9Q00887 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
PSG9Q00887 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PSG9Q00887 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PSG9Q00887 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PSG9Q00887 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PSG9Q00887 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PSG9Q00887 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PSG9Q00887 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PSG9Q00887 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PSG9Q00887 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PSG9Q00887 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PSG9Q00887 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PSG9Q00887 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PSG9Q00887 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PSG9Q00887 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PSG9Q00887 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PSG9Q00887 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PSG9Q00887 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PSG9Q00887 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PSG9Q00887 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PSG9Q00887 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PSG9Q00887 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PSG9Q00887 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
PSG9Q00887 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
PSG9Q00887 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PSG9Q00887 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PSG9Q00887 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PSG9Q00887 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PSG9Q00887 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
PSG9Q00887 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PSG9Q00887 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PSG9Q00887 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PSG9Q00887 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PSG9Q00887 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PSG9Q00887 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
PSG9Q00887 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
PSG9Q00887 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PSG9Q00887 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PSG9Q00887 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
PSG9Q00887 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PSG9Q00887 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PSG9Q00887 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PSG9Q00887 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PSG9Q00887 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PSG9Q00887 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PSG9Q00887 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PSG9Q00887 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PSG9Q00887 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PSG9Q00887 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PSG9Q00887 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PSG9Q00887 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PSG9Q00887 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PSG9Q00887 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PSG9Q00887 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PSG9Q00887 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PSG9Q00887 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PSG9Q00887 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PSG9Q00887 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PSG9Q00887 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
PSG9Q00887 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
PSG9Q00887 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
PSG9Q00887 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
PSG9Q00887 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
PSG9Q00887 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
PSG9Q00887 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
PSG9Q00887 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
PSG9Q00887 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PSG9Q00887 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PSG9Q00887 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PSG9Q00887 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PSG9Q00887 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PSG9Q00887 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
PSG9Q00887 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC15.08■□□□□ 0
PSG9Q00887 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC15.08■□□□□ 0
PSG9Q00887 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PSG9Q00887 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
PSG9Q00887 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
PSG9Q00887 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
PSG9Q00887 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
PSG9Q00887 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.2 ms