Protein–RNA interactions for Protein: P83916

CBX1, Chromobox protein homolog 1, humanhuman

Predictions only

Length 185 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBX1P83916 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CBX1P83916 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
CBX1P83916 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
CBX1P83916 EWSR1-222ENST00000629659 2446 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.87
CBX1P83916 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
CBX1P83916 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
CBX1P83916 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
CBX1P83916 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CBX1P83916 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CBX1P83916 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CBX1P83916 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CBX1P83916 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CBX1P83916 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CBX1P83916 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CBX1P83916 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CBX1P83916 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CBX1P83916 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CBX1P83916 RECK-201ENST00000377966 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CBX1P83916 DCAF12L2-201ENST00000360028 2599 ntAPPRIS P1 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CBX1P83916 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
CBX1P83916 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CBX1P83916 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CBX1P83916 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CBX1P83916 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CBX1P83916 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CBX1P83916 LBX1-201ENST00000370193 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CBX1P83916 MFSD11-202ENST00000355954 2832 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CBX1P83916 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CBX1P83916 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CBX1P83916 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CBX1P83916 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CBX1P83916 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CBX1P83916 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CBX1P83916 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CBX1P83916 MAPK8IP1-202ENST00000395629 3180 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CBX1P83916 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CBX1P83916 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
CBX1P83916 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CBX1P83916 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CBX1P83916 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CBX1P83916 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CBX1P83916 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CBX1P83916 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CBX1P83916 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CBX1P83916 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CBX1P83916 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CBX1P83916 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CBX1P83916 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
CBX1P83916 C12orf29-201ENST00000356891 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CBX1P83916 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CBX1P83916 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CBX1P83916 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CBX1P83916 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CBX1P83916 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CBX1P83916 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CBX1P83916 SAMD4A-204ENST00000554335 3003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CBX1P83916 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CBX1P83916 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CBX1P83916 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CBX1P83916 NLGN2-201ENST00000302926 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CBX1P83916 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CBX1P83916 ADRB3-201ENST00000345060 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CBX1P83916 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
CBX1P83916 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CBX1P83916 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CBX1P83916 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CBX1P83916 GLUD1-201ENST00000277865 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CBX1P83916 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
CBX1P83916 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CBX1P83916 U73166.1-201ENST00000439898 2625 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CBX1P83916 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CBX1P83916 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CBX1P83916 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CBX1P83916 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CBX1P83916 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CBX1P83916 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CBX1P83916 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CBX1P83916 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CBX1P83916 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CBX1P83916 MAP4K4-205ENST00000350878 7640 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CBX1P83916 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CBX1P83916 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CBX1P83916 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CBX1P83916 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CBX1P83916 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CBX1P83916 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
CBX1P83916 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CBX1P83916 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CBX1P83916 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CBX1P83916 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CBX1P83916 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CBX1P83916 GDF6-201ENST00000287020 3701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CBX1P83916 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CBX1P83916 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CBX1P83916 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CBX1P83916 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CBX1P83916 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CBX1P83916 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CBX1P83916 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CBX1P83916 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.8 ms