Protein–RNA interactions for Protein: P61587

RND3, Rho-related GTP-binding protein RhoE, humanhuman

Predictions only

Length 244 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RND3P61587 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
RND3P61587 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RND3P61587 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RND3P61587 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RND3P61587 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RND3P61587 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RND3P61587 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RND3P61587 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RND3P61587 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RND3P61587 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RND3P61587 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RND3P61587 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RND3P61587 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RND3P61587 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RND3P61587 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RND3P61587 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RND3P61587 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RND3P61587 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RND3P61587 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RND3P61587 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RND3P61587 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RND3P61587 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RND3P61587 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RND3P61587 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RND3P61587 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RND3P61587 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RND3P61587 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RND3P61587 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RND3P61587 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RND3P61587 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RND3P61587 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RND3P61587 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RND3P61587 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RND3P61587 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RND3P61587 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RND3P61587 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RND3P61587 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RND3P61587 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RND3P61587 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RND3P61587 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RND3P61587 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RND3P61587 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RND3P61587 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RND3P61587 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RND3P61587 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RND3P61587 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RND3P61587 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RND3P61587 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RND3P61587 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RND3P61587 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RND3P61587 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RND3P61587 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RND3P61587 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
RND3P61587 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RND3P61587 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RND3P61587 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
RND3P61587 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RND3P61587 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RND3P61587 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RND3P61587 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RND3P61587 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RND3P61587 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RND3P61587 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RND3P61587 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RND3P61587 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RND3P61587 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RND3P61587 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
RND3P61587 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RND3P61587 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
RND3P61587 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RND3P61587 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RND3P61587 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RND3P61587 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RND3P61587 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RND3P61587 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RND3P61587 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RND3P61587 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
RND3P61587 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RND3P61587 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RND3P61587 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RND3P61587 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RND3P61587 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
RND3P61587 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RND3P61587 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RND3P61587 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RND3P61587 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RND3P61587 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RND3P61587 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
RND3P61587 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RND3P61587 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RND3P61587 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RND3P61587 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RND3P61587 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RND3P61587 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RND3P61587 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
RND3P61587 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RND3P61587 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RND3P61587 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RND3P61587 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RND3P61587 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.7 ms