Protein–RNA interactions for Protein: P61221

ABCE1, ATP-binding cassette sub-family E member 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 599 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCE1P61221 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
ABCE1P61221 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
ABCE1P61221 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
ABCE1P61221 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
ABCE1P61221 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
ABCE1P61221 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC19.26■□□□□ 0.67
ABCE1P61221 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
ABCE1P61221 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
ABCE1P61221 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
ABCE1P61221 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
ABCE1P61221 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
ABCE1P61221 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
ABCE1P61221 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
ABCE1P61221 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
ABCE1P61221 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
ABCE1P61221 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
ABCE1P61221 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
ABCE1P61221 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
ABCE1P61221 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
ABCE1P61221 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
ABCE1P61221 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
ABCE1P61221 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
ABCE1P61221 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
ABCE1P61221 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
ABCE1P61221 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
ABCE1P61221 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
ABCE1P61221 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
ABCE1P61221 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
ABCE1P61221 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
ABCE1P61221 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
ABCE1P61221 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
ABCE1P61221 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
ABCE1P61221 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
ABCE1P61221 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
ABCE1P61221 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC19.25■□□□□ 0.67
ABCE1P61221 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
ABCE1P61221 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
ABCE1P61221 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
ABCE1P61221 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
ABCE1P61221 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
ABCE1P61221 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
ABCE1P61221 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
ABCE1P61221 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
ABCE1P61221 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
ABCE1P61221 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
ABCE1P61221 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
ABCE1P61221 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
ABCE1P61221 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
ABCE1P61221 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
ABCE1P61221 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
ABCE1P61221 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
ABCE1P61221 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
ABCE1P61221 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
ABCE1P61221 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
ABCE1P61221 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
ABCE1P61221 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
ABCE1P61221 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
ABCE1P61221 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
ABCE1P61221 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
ABCE1P61221 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
ABCE1P61221 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
ABCE1P61221 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
ABCE1P61221 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
ABCE1P61221 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
ABCE1P61221 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
ABCE1P61221 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
ABCE1P61221 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
ABCE1P61221 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
ABCE1P61221 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
ABCE1P61221 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
ABCE1P61221 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
ABCE1P61221 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
ABCE1P61221 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
ABCE1P61221 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
ABCE1P61221 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
ABCE1P61221 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
ABCE1P61221 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
ABCE1P61221 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
ABCE1P61221 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
ABCE1P61221 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
ABCE1P61221 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
ABCE1P61221 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
ABCE1P61221 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
ABCE1P61221 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
ABCE1P61221 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
ABCE1P61221 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
ABCE1P61221 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
ABCE1P61221 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
ABCE1P61221 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
ABCE1P61221 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
ABCE1P61221 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
ABCE1P61221 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
ABCE1P61221 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
ABCE1P61221 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
ABCE1P61221 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
ABCE1P61221 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
ABCE1P61221 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
ABCE1P61221 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
ABCE1P61221 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
ABCE1P61221 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.8 ms