Protein–RNA interactions for Protein: P61204

ARF3, ADP-ribosylation factor 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 181 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARF3P61204 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ARF3P61204 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ARF3P61204 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
ARF3P61204 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
ARF3P61204 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ARF3P61204 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
ARF3P61204 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ARF3P61204 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ARF3P61204 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ARF3P61204 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ARF3P61204 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC18.71■□□□□ 0.59
ARF3P61204 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ARF3P61204 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
ARF3P61204 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
ARF3P61204 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
ARF3P61204 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ARF3P61204 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
ARF3P61204 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
ARF3P61204 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC18.71■□□□□ 0.59
ARF3P61204 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
ARF3P61204 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
ARF3P61204 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ARF3P61204 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ARF3P61204 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
ARF3P61204 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ARF3P61204 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ARF3P61204 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
ARF3P61204 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ARF3P61204 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
ARF3P61204 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
ARF3P61204 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ARF3P61204 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
ARF3P61204 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ARF3P61204 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
ARF3P61204 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
ARF3P61204 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
ARF3P61204 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
ARF3P61204 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
ARF3P61204 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
ARF3P61204 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ARF3P61204 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ARF3P61204 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ARF3P61204 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
ARF3P61204 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
ARF3P61204 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ARF3P61204 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
ARF3P61204 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
ARF3P61204 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
ARF3P61204 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
ARF3P61204 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ARF3P61204 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ARF3P61204 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ARF3P61204 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
ARF3P61204 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
ARF3P61204 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ARF3P61204 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
ARF3P61204 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
ARF3P61204 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
ARF3P61204 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ARF3P61204 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ARF3P61204 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ARF3P61204 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
ARF3P61204 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
ARF3P61204 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
ARF3P61204 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
ARF3P61204 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
ARF3P61204 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
ARF3P61204 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
ARF3P61204 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
ARF3P61204 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
ARF3P61204 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
ARF3P61204 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
ARF3P61204 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
ARF3P61204 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
ARF3P61204 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
ARF3P61204 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
ARF3P61204 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
ARF3P61204 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
ARF3P61204 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
ARF3P61204 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
ARF3P61204 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
ARF3P61204 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
ARF3P61204 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
ARF3P61204 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
ARF3P61204 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
ARF3P61204 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
ARF3P61204 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
ARF3P61204 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
ARF3P61204 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
ARF3P61204 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
ARF3P61204 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
ARF3P61204 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
ARF3P61204 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
ARF3P61204 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
ARF3P61204 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
ARF3P61204 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
ARF3P61204 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
ARF3P61204 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
ARF3P61204 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
ARF3P61204 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 78.7 ms