Protein–RNA interactions for Protein: P61020

RAB5B, Ras-related protein Rab-5B, humanhuman

Predictions only

Length 215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB5BP61020 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RAB5BP61020 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RAB5BP61020 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RAB5BP61020 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RAB5BP61020 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RAB5BP61020 POU4F2-201ENST00000281321 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RAB5BP61020 JAK3-201ENST00000458235 5432 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RAB5BP61020 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RAB5BP61020 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RAB5BP61020 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RAB5BP61020 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RAB5BP61020 ZC3H7B-201ENST00000352645 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RAB5BP61020 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RAB5BP61020 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RAB5BP61020 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RAB5BP61020 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RAB5BP61020 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RAB5BP61020 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RAB5BP61020 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RAB5BP61020 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RAB5BP61020 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RAB5BP61020 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RAB5BP61020 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RAB5BP61020 TSPOAP1-202ENST00000343736 5947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RAB5BP61020 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RAB5BP61020 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RAB5BP61020 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
RAB5BP61020 AC018695.7-201ENST00000624587 2492 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
RAB5BP61020 BTBD11-205ENST00000490090 4614 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RAB5BP61020 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RAB5BP61020 RTL6-201ENST00000341255 5495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RAB5BP61020 MAP2K5-201ENST00000178640 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RAB5BP61020 TAF3-201ENST00000344293 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RAB5BP61020 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RAB5BP61020 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RAB5BP61020 ELMSAN1-201ENST00000286523 8091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RAB5BP61020 AC004943.2-201ENST00000563328 4842 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RAB5BP61020 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RAB5BP61020 WASF1-206ENST00000392588 3122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RAB5BP61020 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RAB5BP61020 HNRNPUL2-BSCL2-201ENST00000403734 4001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RAB5BP61020 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RAB5BP61020 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RAB5BP61020 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RAB5BP61020 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RAB5BP61020 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RAB5BP61020 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RAB5BP61020 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RAB5BP61020 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RAB5BP61020 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RAB5BP61020 CYP2U1-202ENST00000508453 3125 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RAB5BP61020 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RAB5BP61020 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RAB5BP61020 ARHGAP39-202ENST00000377307 4673 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RAB5BP61020 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RAB5BP61020 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RAB5BP61020 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RAB5BP61020 SIKE1-203ENST00000369528 5506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RAB5BP61020 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RAB5BP61020 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RAB5BP61020 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RAB5BP61020 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RAB5BP61020 KL-201ENST00000380099 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RAB5BP61020 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RAB5BP61020 YY1-201ENST00000262238 6697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RAB5BP61020 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RAB5BP61020 DKC1-201ENST00000369550 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RAB5BP61020 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RAB5BP61020 CPEB2-201ENST00000259997 5612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RAB5BP61020 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RAB5BP61020 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RAB5BP61020 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RAB5BP61020 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RAB5BP61020 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RAB5BP61020 GNAL-202ENST00000334049 6535 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RAB5BP61020 GDE1-201ENST00000353258 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RAB5BP61020 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
RAB5BP61020 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RAB5BP61020 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RAB5BP61020 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RAB5BP61020 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RAB5BP61020 TBC1D2B-201ENST00000300584 6067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RAB5BP61020 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RAB5BP61020 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RAB5BP61020 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RAB5BP61020 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RAB5BP61020 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RAB5BP61020 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RAB5BP61020 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RAB5BP61020 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RAB5BP61020 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
RAB5BP61020 PML-215ENST00000565898 5393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RAB5BP61020 CBX6-202ENST00000407418 6122 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RAB5BP61020 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RAB5BP61020 STK35-201ENST00000381482 6685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RAB5BP61020 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RAB5BP61020 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RAB5BP61020 SCAP-201ENST00000265565 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RAB5BP61020 TMEM132E-201ENST00000321639 5631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RAB5BP61020 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.3 ms