Protein–RNA interactions for Protein: P60880

SNAP25, Synaptosomal-associated protein 25, humanhuman

Predictions only

Length 206 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNAP25P60880 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
SNAP25P60880 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SNAP25P60880 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SNAP25P60880 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SNAP25P60880 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SNAP25P60880 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SNAP25P60880 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SNAP25P60880 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SNAP25P60880 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SNAP25P60880 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SNAP25P60880 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SNAP25P60880 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SNAP25P60880 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
SNAP25P60880 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
SNAP25P60880 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SNAP25P60880 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SNAP25P60880 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SNAP25P60880 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SNAP25P60880 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SNAP25P60880 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SNAP25P60880 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SNAP25P60880 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SNAP25P60880 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SNAP25P60880 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SNAP25P60880 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SNAP25P60880 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
SNAP25P60880 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SNAP25P60880 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SNAP25P60880 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SNAP25P60880 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SNAP25P60880 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SNAP25P60880 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SNAP25P60880 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SNAP25P60880 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SNAP25P60880 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SNAP25P60880 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SNAP25P60880 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SNAP25P60880 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SNAP25P60880 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SNAP25P60880 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SNAP25P60880 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SNAP25P60880 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SNAP25P60880 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SNAP25P60880 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
SNAP25P60880 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SNAP25P60880 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SNAP25P60880 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SNAP25P60880 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SNAP25P60880 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SNAP25P60880 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
SNAP25P60880 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
SNAP25P60880 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SNAP25P60880 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SNAP25P60880 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SNAP25P60880 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SNAP25P60880 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SNAP25P60880 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SNAP25P60880 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SNAP25P60880 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SNAP25P60880 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SNAP25P60880 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SNAP25P60880 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SNAP25P60880 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SNAP25P60880 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SNAP25P60880 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SNAP25P60880 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SNAP25P60880 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SNAP25P60880 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
SNAP25P60880 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SNAP25P60880 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SNAP25P60880 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SNAP25P60880 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SNAP25P60880 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SNAP25P60880 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SNAP25P60880 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SNAP25P60880 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
SNAP25P60880 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SNAP25P60880 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SNAP25P60880 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SNAP25P60880 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SNAP25P60880 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SNAP25P60880 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SNAP25P60880 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SNAP25P60880 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SNAP25P60880 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SNAP25P60880 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SNAP25P60880 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
SNAP25P60880 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SNAP25P60880 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SNAP25P60880 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SNAP25P60880 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SNAP25P60880 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SNAP25P60880 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SNAP25P60880 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SNAP25P60880 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SNAP25P60880 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SNAP25P60880 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SNAP25P60880 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SNAP25P60880 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SNAP25P60880 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.7 ms