Protein–RNA interactions for Protein: P57735

RAB25, Ras-related protein Rab-25, humanhuman

Predictions only

Length 213 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB25P57735 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
RAB25P57735 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
RAB25P57735 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
RAB25P57735 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
RAB25P57735 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
RAB25P57735 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
RAB25P57735 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
RAB25P57735 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
RAB25P57735 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
RAB25P57735 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
RAB25P57735 TRIM24-201ENST00000343526 8410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
RAB25P57735 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
RAB25P57735 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
RAB25P57735 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
RAB25P57735 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
RAB25P57735 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
RAB25P57735 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
RAB25P57735 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
RAB25P57735 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
RAB25P57735 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
RAB25P57735 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
RAB25P57735 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
RAB25P57735 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
RAB25P57735 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
RAB25P57735 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
RAB25P57735 KDM5C-204ENST00000375401 6031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
RAB25P57735 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
RAB25P57735 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
RAB25P57735 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
RAB25P57735 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
RAB25P57735 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
RAB25P57735 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
RAB25P57735 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
RAB25P57735 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
RAB25P57735 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
RAB25P57735 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
RAB25P57735 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
RAB25P57735 MAGI3-201ENST00000307546 6430 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
RAB25P57735 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
RAB25P57735 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
RAB25P57735 SLC8A3-202ENST00000356921 5250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
RAB25P57735 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
RAB25P57735 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.33
RAB25P57735 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
RAB25P57735 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
RAB25P57735 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
RAB25P57735 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
RAB25P57735 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
RAB25P57735 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
RAB25P57735 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
RAB25P57735 ADGRB2-201ENST00000373655 5400 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
RAB25P57735 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
RAB25P57735 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
RAB25P57735 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
RAB25P57735 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
RAB25P57735 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
RAB25P57735 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
RAB25P57735 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
RAB25P57735 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
RAB25P57735 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
RAB25P57735 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
RAB25P57735 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
RAB25P57735 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
RAB25P57735 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
RAB25P57735 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
RAB25P57735 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
RAB25P57735 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
RAB25P57735 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
RAB25P57735 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
RAB25P57735 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
RAB25P57735 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
RAB25P57735 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
RAB25P57735 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
RAB25P57735 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
RAB25P57735 MINDY2-202ENST00000450403 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
RAB25P57735 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
RAB25P57735 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
RAB25P57735 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
RAB25P57735 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
RAB25P57735 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
RAB25P57735 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
RAB25P57735 TAOK2-202ENST00000308893 5169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
RAB25P57735 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
RAB25P57735 GPD2-201ENST00000310454 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
RAB25P57735 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
RAB25P57735 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
RAB25P57735 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
RAB25P57735 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
RAB25P57735 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
RAB25P57735 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
RAB25P57735 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
RAB25P57735 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
RAB25P57735 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
RAB25P57735 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
RAB25P57735 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
RAB25P57735 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
RAB25P57735 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
RAB25P57735 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
RAB25P57735 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
RAB25P57735 MAP7-209ENST00000618822 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.3 ms