Protein–RNA interactions for Protein: P57059

SIK1, Serine/threonine-protein kinase SIK1, humanhuman

Predictions only

Length 783 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIK1P57059 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SIK1P57059 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SIK1P57059 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SIK1P57059 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SIK1P57059 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SIK1P57059 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
SIK1P57059 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SIK1P57059 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SIK1P57059 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SIK1P57059 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SIK1P57059 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SIK1P57059 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SIK1P57059 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
SIK1P57059 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SIK1P57059 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
SIK1P57059 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SIK1P57059 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SIK1P57059 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
SIK1P57059 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
SIK1P57059 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
SIK1P57059 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SIK1P57059 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SIK1P57059 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SIK1P57059 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SIK1P57059 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SIK1P57059 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
SIK1P57059 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
SIK1P57059 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SIK1P57059 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SIK1P57059 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SIK1P57059 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SIK1P57059 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SIK1P57059 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SIK1P57059 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SIK1P57059 FAM41C-202ENST00000432963 504 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SIK1P57059 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SIK1P57059 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SIK1P57059 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
SIK1P57059 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SIK1P57059 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
SIK1P57059 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SIK1P57059 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SIK1P57059 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SIK1P57059 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SIK1P57059 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SIK1P57059 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SIK1P57059 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SIK1P57059 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SIK1P57059 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SIK1P57059 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SIK1P57059 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SIK1P57059 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SIK1P57059 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SIK1P57059 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SIK1P57059 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SIK1P57059 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SIK1P57059 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SIK1P57059 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SIK1P57059 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SIK1P57059 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SIK1P57059 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SIK1P57059 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SIK1P57059 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SIK1P57059 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SIK1P57059 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SIK1P57059 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
SIK1P57059 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SIK1P57059 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
SIK1P57059 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25■■□□□ 1.59
SIK1P57059 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SIK1P57059 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SIK1P57059 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC25■■□□□ 1.59
SIK1P57059 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SIK1P57059 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
SIK1P57059 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC25■■□□□ 1.59
SIK1P57059 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SIK1P57059 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
SIK1P57059 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
SIK1P57059 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SIK1P57059 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SIK1P57059 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SIK1P57059 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SIK1P57059 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SIK1P57059 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SIK1P57059 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SIK1P57059 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
SIK1P57059 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SIK1P57059 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
SIK1P57059 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SIK1P57059 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
SIK1P57059 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
SIK1P57059 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
SIK1P57059 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SIK1P57059 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
SIK1P57059 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
SIK1P57059 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SIK1P57059 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC24.99■■□□□ 1.59
SIK1P57059 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SIK1P57059 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SIK1P57059 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.2 ms