Protein–RNA interactions for Protein: P57055

RIPPLY3, Protein ripply3, humanhuman

Predictions only

Length 190 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIPPLY3P57055 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC16.2■□□□□ 0.18
RIPPLY3P57055 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RIPPLY3P57055 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
RIPPLY3P57055 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
RIPPLY3P57055 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
RIPPLY3P57055 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
RIPPLY3P57055 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RIPPLY3P57055 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RIPPLY3P57055 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RIPPLY3P57055 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RIPPLY3P57055 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RIPPLY3P57055 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RIPPLY3P57055 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RIPPLY3P57055 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
RIPPLY3P57055 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
RIPPLY3P57055 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RIPPLY3P57055 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
RIPPLY3P57055 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RIPPLY3P57055 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RIPPLY3P57055 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
RIPPLY3P57055 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RIPPLY3P57055 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
RIPPLY3P57055 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RIPPLY3P57055 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
RIPPLY3P57055 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
RIPPLY3P57055 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
RIPPLY3P57055 TMEM219-201ENST00000279396 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RIPPLY3P57055 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RIPPLY3P57055 TCF20-203ENST00000404876 1058 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
RIPPLY3P57055 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
RIPPLY3P57055 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
RIPPLY3P57055 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RIPPLY3P57055 C5orf66-202ENST00000507641 547 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
RIPPLY3P57055 SEC23A-206ENST00000553970 574 ntTSL 4 BASIC16.19■□□□□ 0.18
RIPPLY3P57055 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
RIPPLY3P57055 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
RIPPLY3P57055 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RIPPLY3P57055 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RIPPLY3P57055 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
RIPPLY3P57055 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RIPPLY3P57055 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RIPPLY3P57055 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RIPPLY3P57055 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RIPPLY3P57055 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
RIPPLY3P57055 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RIPPLY3P57055 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RIPPLY3P57055 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RIPPLY3P57055 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RIPPLY3P57055 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
RIPPLY3P57055 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RIPPLY3P57055 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RIPPLY3P57055 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RIPPLY3P57055 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
RIPPLY3P57055 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
RIPPLY3P57055 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
RIPPLY3P57055 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RIPPLY3P57055 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RIPPLY3P57055 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RIPPLY3P57055 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RIPPLY3P57055 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RIPPLY3P57055 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RIPPLY3P57055 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
RIPPLY3P57055 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RIPPLY3P57055 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RIPPLY3P57055 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RIPPLY3P57055 METTL21A-202ENST00000406927 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RIPPLY3P57055 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
RIPPLY3P57055 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
RIPPLY3P57055 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
RIPPLY3P57055 PRSS21-202ENST00000450020 1106 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RIPPLY3P57055 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
RIPPLY3P57055 PAEP-208ENST00000479141 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RIPPLY3P57055 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
RIPPLY3P57055 L2HGDH-205ENST00000555423 841 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RIPPLY3P57055 METTL23-202ENST00000586200 465 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RIPPLY3P57055 METTL23-212ENST00000590964 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RIPPLY3P57055 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
RIPPLY3P57055 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
RIPPLY3P57055 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RIPPLY3P57055 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
RIPPLY3P57055 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RIPPLY3P57055 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RIPPLY3P57055 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
RIPPLY3P57055 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
RIPPLY3P57055 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RIPPLY3P57055 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
RIPPLY3P57055 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
RIPPLY3P57055 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
RIPPLY3P57055 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RIPPLY3P57055 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RIPPLY3P57055 UBXN1-201ENST00000294119 1291 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RIPPLY3P57055 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RIPPLY3P57055 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
RIPPLY3P57055 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
RIPPLY3P57055 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
RIPPLY3P57055 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
RIPPLY3P57055 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
RIPPLY3P57055 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
RIPPLY3P57055 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
RIPPLY3P57055 TEX264-216ENST00000614067 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.4 ms