Protein–RNA interactions for Protein: P54725

RAD23A, UV excision repair protein RAD23 homolog A, humanhuman

Predictions only

Length 363 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAD23AP54725 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RAD23AP54725 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RAD23AP54725 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RAD23AP54725 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RAD23AP54725 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RAD23AP54725 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RAD23AP54725 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RAD23AP54725 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RAD23AP54725 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RAD23AP54725 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
RAD23AP54725 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RAD23AP54725 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RAD23AP54725 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RAD23AP54725 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RAD23AP54725 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RAD23AP54725 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RAD23AP54725 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RAD23AP54725 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RAD23AP54725 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RAD23AP54725 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RAD23AP54725 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RAD23AP54725 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RAD23AP54725 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RAD23AP54725 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RAD23AP54725 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RAD23AP54725 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RAD23AP54725 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RAD23AP54725 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RAD23AP54725 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RAD23AP54725 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RAD23AP54725 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
RAD23AP54725 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RAD23AP54725 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
RAD23AP54725 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RAD23AP54725 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RAD23AP54725 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RAD23AP54725 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RAD23AP54725 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RAD23AP54725 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
RAD23AP54725 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
RAD23AP54725 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RAD23AP54725 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
RAD23AP54725 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RAD23AP54725 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RAD23AP54725 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
RAD23AP54725 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RAD23AP54725 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
RAD23AP54725 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RAD23AP54725 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
RAD23AP54725 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RAD23AP54725 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RAD23AP54725 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RAD23AP54725 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
RAD23AP54725 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
RAD23AP54725 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
RAD23AP54725 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
RAD23AP54725 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
RAD23AP54725 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
RAD23AP54725 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
RAD23AP54725 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
RAD23AP54725 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
RAD23AP54725 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
RAD23AP54725 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
RAD23AP54725 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
RAD23AP54725 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
RAD23AP54725 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
RAD23AP54725 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
RAD23AP54725 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
RAD23AP54725 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
RAD23AP54725 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
RAD23AP54725 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
RAD23AP54725 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
RAD23AP54725 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
RAD23AP54725 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
RAD23AP54725 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.5
RAD23AP54725 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.5
RAD23AP54725 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
RAD23AP54725 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
RAD23AP54725 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
RAD23AP54725 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
RAD23AP54725 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
RAD23AP54725 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
RAD23AP54725 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
RAD23AP54725 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
RAD23AP54725 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
RAD23AP54725 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
RAD23AP54725 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
RAD23AP54725 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
RAD23AP54725 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
RAD23AP54725 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
RAD23AP54725 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.2■□□□□ 0.5
RAD23AP54725 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
RAD23AP54725 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
RAD23AP54725 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC18.2■□□□□ 0.5
RAD23AP54725 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
RAD23AP54725 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
RAD23AP54725 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
RAD23AP54725 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
RAD23AP54725 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
RAD23AP54725 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.3 ms