Protein–RNA interactions for Protein: P53539

FOSB, Protein fosB, humanhuman

Predictions only

Length 338 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOSBP53539 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
FOSBP53539 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
FOSBP53539 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
FOSBP53539 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
FOSBP53539 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
FOSBP53539 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
FOSBP53539 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
FOSBP53539 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
FOSBP53539 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
FOSBP53539 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
FOSBP53539 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC22.84■■□□□ 1.25
FOSBP53539 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC22.84■■□□□ 1.25
FOSBP53539 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
FOSBP53539 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
FOSBP53539 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
FOSBP53539 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
FOSBP53539 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
FOSBP53539 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
FOSBP53539 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
FOSBP53539 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
FOSBP53539 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
FOSBP53539 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
FOSBP53539 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
FOSBP53539 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
FOSBP53539 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
FOSBP53539 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
FOSBP53539 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
FOSBP53539 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
FOSBP53539 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
FOSBP53539 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
FOSBP53539 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
FOSBP53539 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
FOSBP53539 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
FOSBP53539 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
FOSBP53539 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
FOSBP53539 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
FOSBP53539 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
FOSBP53539 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
FOSBP53539 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
FOSBP53539 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
FOSBP53539 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
FOSBP53539 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
FOSBP53539 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
FOSBP53539 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
FOSBP53539 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
FOSBP53539 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
FOSBP53539 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
FOSBP53539 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
FOSBP53539 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
FOSBP53539 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
FOSBP53539 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
FOSBP53539 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
FOSBP53539 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
FOSBP53539 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
FOSBP53539 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
FOSBP53539 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
FOSBP53539 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
FOSBP53539 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
FOSBP53539 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
FOSBP53539 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
FOSBP53539 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
FOSBP53539 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
FOSBP53539 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
FOSBP53539 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
FOSBP53539 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
FOSBP53539 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
FOSBP53539 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
FOSBP53539 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
FOSBP53539 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
FOSBP53539 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
FOSBP53539 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
FOSBP53539 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
FOSBP53539 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
FOSBP53539 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
FOSBP53539 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
FOSBP53539 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
FOSBP53539 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
FOSBP53539 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
FOSBP53539 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC22.81■■□□□ 1.24
FOSBP53539 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
FOSBP53539 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
FOSBP53539 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
FOSBP53539 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
FOSBP53539 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
FOSBP53539 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
FOSBP53539 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
FOSBP53539 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
FOSBP53539 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
FOSBP53539 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
FOSBP53539 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
FOSBP53539 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
FOSBP53539 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
FOSBP53539 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
FOSBP53539 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
FOSBP53539 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
FOSBP53539 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
FOSBP53539 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
FOSBP53539 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
FOSBP53539 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
FOSBP53539 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.1 ms