Protein–RNA interactions for Protein: P52951

GBX2, Homeobox protein GBX-2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 348 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GBX2P52951 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
GBX2P52951 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
GBX2P52951 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
GBX2P52951 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
GBX2P52951 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
GBX2P52951 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
GBX2P52951 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
GBX2P52951 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
GBX2P52951 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
GBX2P52951 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
GBX2P52951 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
GBX2P52951 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
GBX2P52951 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
GBX2P52951 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
GBX2P52951 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
GBX2P52951 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
GBX2P52951 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
GBX2P52951 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
GBX2P52951 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
GBX2P52951 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
GBX2P52951 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
GBX2P52951 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
GBX2P52951 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
GBX2P52951 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
GBX2P52951 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
GBX2P52951 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
GBX2P52951 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
GBX2P52951 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
GBX2P52951 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
GBX2P52951 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
GBX2P52951 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
GBX2P52951 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
GBX2P52951 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
GBX2P52951 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
GBX2P52951 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
GBX2P52951 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
GBX2P52951 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
GBX2P52951 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
GBX2P52951 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
GBX2P52951 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
GBX2P52951 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
GBX2P52951 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
GBX2P52951 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
GBX2P52951 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
GBX2P52951 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
GBX2P52951 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
GBX2P52951 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
GBX2P52951 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
GBX2P52951 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
GBX2P52951 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
GBX2P52951 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
GBX2P52951 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
GBX2P52951 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
GBX2P52951 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
GBX2P52951 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
GBX2P52951 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
GBX2P52951 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
GBX2P52951 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
GBX2P52951 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
GBX2P52951 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
GBX2P52951 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
GBX2P52951 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
GBX2P52951 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
GBX2P52951 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC17.41■□□□□ 0.38
GBX2P52951 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
GBX2P52951 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
GBX2P52951 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
GBX2P52951 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
GBX2P52951 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
GBX2P52951 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
GBX2P52951 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
GBX2P52951 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
GBX2P52951 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
GBX2P52951 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
GBX2P52951 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
GBX2P52951 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
GBX2P52951 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
GBX2P52951 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
GBX2P52951 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
GBX2P52951 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
GBX2P52951 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
GBX2P52951 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
GBX2P52951 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
GBX2P52951 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
GBX2P52951 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
GBX2P52951 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
GBX2P52951 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC17.4■□□□□ 0.38
GBX2P52951 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
GBX2P52951 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
GBX2P52951 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
GBX2P52951 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
GBX2P52951 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
GBX2P52951 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
GBX2P52951 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
GBX2P52951 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
GBX2P52951 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
GBX2P52951 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
GBX2P52951 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
GBX2P52951 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
GBX2P52951 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.7 ms