Protein–RNA interactions for Protein: P52657

GTF2A2, Transcription initiation factor IIA subunit 2, humanhuman

Predictions only

Length 109 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2A2P52657 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
GTF2A2P52657 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
GTF2A2P52657 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
GTF2A2P52657 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC22.66■■□□□ 1.22
GTF2A2P52657 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
GTF2A2P52657 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
GTF2A2P52657 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
GTF2A2P52657 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
GTF2A2P52657 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
GTF2A2P52657 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
GTF2A2P52657 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
GTF2A2P52657 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
GTF2A2P52657 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
GTF2A2P52657 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
GTF2A2P52657 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
GTF2A2P52657 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
GTF2A2P52657 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
GTF2A2P52657 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
GTF2A2P52657 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
GTF2A2P52657 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
GTF2A2P52657 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
GTF2A2P52657 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
GTF2A2P52657 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
GTF2A2P52657 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
GTF2A2P52657 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
GTF2A2P52657 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
GTF2A2P52657 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
GTF2A2P52657 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
GTF2A2P52657 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
GTF2A2P52657 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
GTF2A2P52657 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
GTF2A2P52657 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
GTF2A2P52657 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
GTF2A2P52657 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
GTF2A2P52657 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
GTF2A2P52657 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
GTF2A2P52657 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
GTF2A2P52657 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
GTF2A2P52657 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
GTF2A2P52657 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
GTF2A2P52657 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
GTF2A2P52657 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
GTF2A2P52657 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
GTF2A2P52657 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
GTF2A2P52657 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
GTF2A2P52657 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
GTF2A2P52657 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
GTF2A2P52657 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
GTF2A2P52657 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
GTF2A2P52657 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
GTF2A2P52657 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
GTF2A2P52657 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
GTF2A2P52657 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
GTF2A2P52657 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
GTF2A2P52657 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
GTF2A2P52657 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
GTF2A2P52657 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
GTF2A2P52657 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
GTF2A2P52657 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
GTF2A2P52657 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
GTF2A2P52657 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
GTF2A2P52657 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
GTF2A2P52657 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
GTF2A2P52657 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
GTF2A2P52657 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
GTF2A2P52657 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
GTF2A2P52657 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
GTF2A2P52657 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
GTF2A2P52657 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
GTF2A2P52657 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
GTF2A2P52657 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
GTF2A2P52657 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
GTF2A2P52657 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
GTF2A2P52657 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
GTF2A2P52657 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
GTF2A2P52657 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
GTF2A2P52657 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
GTF2A2P52657 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
GTF2A2P52657 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
GTF2A2P52657 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
GTF2A2P52657 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
GTF2A2P52657 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
GTF2A2P52657 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
GTF2A2P52657 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
GTF2A2P52657 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
GTF2A2P52657 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
GTF2A2P52657 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
GTF2A2P52657 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
GTF2A2P52657 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
GTF2A2P52657 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
GTF2A2P52657 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
GTF2A2P52657 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
GTF2A2P52657 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
GTF2A2P52657 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
GTF2A2P52657 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
GTF2A2P52657 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
GTF2A2P52657 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
GTF2A2P52657 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
GTF2A2P52657 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
GTF2A2P52657 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.1 ms