Protein–RNA interactions for Protein: P50548

ERF, ETS domain-containing transcription factor ERF, humanhuman

Predictions only

Length 548 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERFP50548 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
ERFP50548 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
ERFP50548 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
ERFP50548 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
ERFP50548 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
ERFP50548 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
ERFP50548 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
ERFP50548 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
ERFP50548 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
ERFP50548 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
ERFP50548 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
ERFP50548 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
ERFP50548 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
ERFP50548 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
ERFP50548 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
ERFP50548 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
ERFP50548 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
ERFP50548 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
ERFP50548 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
ERFP50548 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
ERFP50548 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
ERFP50548 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
ERFP50548 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
ERFP50548 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
ERFP50548 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
ERFP50548 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
ERFP50548 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC18.85■□□□□ 0.61
ERFP50548 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
ERFP50548 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
ERFP50548 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
ERFP50548 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
ERFP50548 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
ERFP50548 TCF3-204ENST00000453954 3585 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
ERFP50548 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
ERFP50548 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
ERFP50548 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
ERFP50548 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
ERFP50548 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
ERFP50548 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
ERFP50548 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
ERFP50548 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
ERFP50548 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
ERFP50548 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
ERFP50548 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
ERFP50548 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
ERFP50548 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
ERFP50548 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
ERFP50548 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
ERFP50548 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
ERFP50548 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
ERFP50548 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
ERFP50548 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
ERFP50548 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
ERFP50548 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
ERFP50548 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
ERFP50548 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
ERFP50548 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
ERFP50548 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
ERFP50548 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
ERFP50548 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
ERFP50548 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
ERFP50548 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
ERFP50548 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
ERFP50548 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
ERFP50548 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
ERFP50548 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
ERFP50548 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
ERFP50548 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
ERFP50548 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
ERFP50548 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
ERFP50548 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
ERFP50548 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC18.84■□□□□ 0.61
ERFP50548 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
ERFP50548 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
ERFP50548 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
ERFP50548 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
ERFP50548 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
ERFP50548 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
ERFP50548 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
ERFP50548 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
ERFP50548 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
ERFP50548 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
ERFP50548 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
ERFP50548 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
ERFP50548 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
ERFP50548 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
ERFP50548 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
ERFP50548 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
ERFP50548 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
ERFP50548 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
ERFP50548 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.61
ERFP50548 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
ERFP50548 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
ERFP50548 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
ERFP50548 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
ERFP50548 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
ERFP50548 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
ERFP50548 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
ERFP50548 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
ERFP50548 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.9 ms