Protein–RNA interactions for Protein: P49848

TAF6, Transcription initiation factor TFIID subunit 6, humanhuman

Predictions only

Length 677 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF6P49848 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
TAF6P49848 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
TAF6P49848 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC20.95■□□□□ 0.94
TAF6P49848 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
TAF6P49848 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
TAF6P49848 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
TAF6P49848 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC20.95■□□□□ 0.94
TAF6P49848 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
TAF6P49848 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
TAF6P49848 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
TAF6P49848 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC20.95■□□□□ 0.94
TAF6P49848 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
TAF6P49848 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
TAF6P49848 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
TAF6P49848 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
TAF6P49848 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
TAF6P49848 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
TAF6P49848 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
TAF6P49848 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
TAF6P49848 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
TAF6P49848 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
TAF6P49848 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
TAF6P49848 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
TAF6P49848 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
TAF6P49848 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
TAF6P49848 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
TAF6P49848 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
TAF6P49848 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
TAF6P49848 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
TAF6P49848 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
TAF6P49848 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
TAF6P49848 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
TAF6P49848 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
TAF6P49848 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
TAF6P49848 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
TAF6P49848 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
TAF6P49848 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
TAF6P49848 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
TAF6P49848 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
TAF6P49848 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
TAF6P49848 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
TAF6P49848 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
TAF6P49848 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
TAF6P49848 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
TAF6P49848 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
TAF6P49848 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
TAF6P49848 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
TAF6P49848 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
TAF6P49848 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
TAF6P49848 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC20.93■□□□□ 0.94
TAF6P49848 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
TAF6P49848 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
TAF6P49848 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
TAF6P49848 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
TAF6P49848 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
TAF6P49848 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
TAF6P49848 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
TAF6P49848 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
TAF6P49848 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
TAF6P49848 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
TAF6P49848 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
TAF6P49848 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
TAF6P49848 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
TAF6P49848 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
TAF6P49848 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
TAF6P49848 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
TAF6P49848 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
TAF6P49848 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
TAF6P49848 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC20.92■□□□□ 0.94
TAF6P49848 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
TAF6P49848 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
TAF6P49848 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
TAF6P49848 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
TAF6P49848 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
TAF6P49848 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
TAF6P49848 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
TAF6P49848 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
TAF6P49848 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
TAF6P49848 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
TAF6P49848 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
TAF6P49848 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
TAF6P49848 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
TAF6P49848 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
TAF6P49848 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
TAF6P49848 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
TAF6P49848 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
TAF6P49848 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC20.91■□□□□ 0.94
TAF6P49848 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
TAF6P49848 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC20.91■□□□□ 0.94
TAF6P49848 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
TAF6P49848 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC20.91■□□□□ 0.94
TAF6P49848 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
TAF6P49848 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
TAF6P49848 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
TAF6P49848 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.91■□□□□ 0.94
TAF6P49848 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
TAF6P49848 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
TAF6P49848 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
TAF6P49848 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
TAF6P49848 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.5 ms