Protein–RNA interactions for Protein: P48788

TNNI2, Troponin I, fast skeletal muscle, humanhuman

Predictions only

Length 182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNNI2P48788 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TNNI2P48788 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TNNI2P48788 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TNNI2P48788 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TNNI2P48788 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TNNI2P48788 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TNNI2P48788 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TNNI2P48788 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TNNI2P48788 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
TNNI2P48788 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TNNI2P48788 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
TNNI2P48788 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TNNI2P48788 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TNNI2P48788 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TNNI2P48788 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TNNI2P48788 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TNNI2P48788 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TNNI2P48788 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TNNI2P48788 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TNNI2P48788 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TNNI2P48788 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
TNNI2P48788 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TNNI2P48788 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TNNI2P48788 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TNNI2P48788 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TNNI2P48788 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TNNI2P48788 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TNNI2P48788 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TNNI2P48788 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TNNI2P48788 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TNNI2P48788 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TNNI2P48788 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TNNI2P48788 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TNNI2P48788 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TNNI2P48788 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TNNI2P48788 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TNNI2P48788 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TNNI2P48788 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TNNI2P48788 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TNNI2P48788 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TNNI2P48788 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TNNI2P48788 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TNNI2P48788 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
TNNI2P48788 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TNNI2P48788 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TNNI2P48788 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TNNI2P48788 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TNNI2P48788 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TNNI2P48788 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TNNI2P48788 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TNNI2P48788 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TNNI2P48788 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TNNI2P48788 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TNNI2P48788 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TNNI2P48788 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TNNI2P48788 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TNNI2P48788 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TNNI2P48788 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TNNI2P48788 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TNNI2P48788 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TNNI2P48788 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TNNI2P48788 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TNNI2P48788 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TNNI2P48788 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TNNI2P48788 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TNNI2P48788 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TNNI2P48788 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
TNNI2P48788 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TNNI2P48788 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
TNNI2P48788 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
TNNI2P48788 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TNNI2P48788 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TNNI2P48788 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TNNI2P48788 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TNNI2P48788 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TNNI2P48788 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TNNI2P48788 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TNNI2P48788 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TNNI2P48788 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TNNI2P48788 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TNNI2P48788 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TNNI2P48788 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TNNI2P48788 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TNNI2P48788 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TNNI2P48788 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TNNI2P48788 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TNNI2P48788 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TNNI2P48788 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TNNI2P48788 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TNNI2P48788 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TNNI2P48788 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TNNI2P48788 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TNNI2P48788 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TNNI2P48788 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
TNNI2P48788 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TNNI2P48788 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TNNI2P48788 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TNNI2P48788 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TNNI2P48788 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TNNI2P48788 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.1 ms