Protein–RNA interactions for Protein: P45954

ACADSB, Short/branched chain specific acyl-CoA dehydrogenase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 432 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACADSBP45954 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
ACADSBP45954 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
ACADSBP45954 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ACADSBP45954 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
ACADSBP45954 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
ACADSBP45954 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
ACADSBP45954 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ACADSBP45954 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
ACADSBP45954 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ACADSBP45954 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ACADSBP45954 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
ACADSBP45954 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC20.59■□□□□ 0.89
ACADSBP45954 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
ACADSBP45954 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
ACADSBP45954 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
ACADSBP45954 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
ACADSBP45954 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ACADSBP45954 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
ACADSBP45954 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ACADSBP45954 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ACADSBP45954 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
ACADSBP45954 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
ACADSBP45954 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
ACADSBP45954 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
ACADSBP45954 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
ACADSBP45954 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
ACADSBP45954 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
ACADSBP45954 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
ACADSBP45954 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
ACADSBP45954 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
ACADSBP45954 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
ACADSBP45954 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
ACADSBP45954 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
ACADSBP45954 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
ACADSBP45954 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
ACADSBP45954 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
ACADSBP45954 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
ACADSBP45954 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
ACADSBP45954 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
ACADSBP45954 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
ACADSBP45954 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
ACADSBP45954 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
ACADSBP45954 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
ACADSBP45954 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
ACADSBP45954 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC20.57■□□□□ 0.88
ACADSBP45954 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
ACADSBP45954 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
ACADSBP45954 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
ACADSBP45954 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
ACADSBP45954 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
ACADSBP45954 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
ACADSBP45954 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
ACADSBP45954 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
ACADSBP45954 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
ACADSBP45954 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC20.57■□□□□ 0.88
ACADSBP45954 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
ACADSBP45954 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
ACADSBP45954 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
ACADSBP45954 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
ACADSBP45954 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
ACADSBP45954 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
ACADSBP45954 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
ACADSBP45954 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
ACADSBP45954 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
ACADSBP45954 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
ACADSBP45954 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
ACADSBP45954 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
ACADSBP45954 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
ACADSBP45954 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
ACADSBP45954 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
ACADSBP45954 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
ACADSBP45954 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
ACADSBP45954 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
ACADSBP45954 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
ACADSBP45954 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
ACADSBP45954 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
ACADSBP45954 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
ACADSBP45954 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
ACADSBP45954 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
ACADSBP45954 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
ACADSBP45954 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
ACADSBP45954 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
ACADSBP45954 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
ACADSBP45954 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
ACADSBP45954 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
ACADSBP45954 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
ACADSBP45954 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
ACADSBP45954 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
ACADSBP45954 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
ACADSBP45954 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
ACADSBP45954 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
ACADSBP45954 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC20.55■□□□□ 0.88
ACADSBP45954 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
ACADSBP45954 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
ACADSBP45954 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
ACADSBP45954 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
ACADSBP45954 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
ACADSBP45954 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
ACADSBP45954 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
ACADSBP45954 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 137 ms