Protein–RNA interactions for Protein: P43351

RAD52, DNA repair protein RAD52 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 418 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAD52P43351 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RAD52P43351 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
RAD52P43351 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
RAD52P43351 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RAD52P43351 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RAD52P43351 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
RAD52P43351 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
RAD52P43351 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RAD52P43351 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RAD52P43351 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RAD52P43351 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RAD52P43351 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RAD52P43351 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
RAD52P43351 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RAD52P43351 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
RAD52P43351 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RAD52P43351 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RAD52P43351 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
RAD52P43351 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
RAD52P43351 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RAD52P43351 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
RAD52P43351 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RAD52P43351 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
RAD52P43351 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RAD52P43351 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RAD52P43351 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
RAD52P43351 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
RAD52P43351 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RAD52P43351 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RAD52P43351 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RAD52P43351 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
RAD52P43351 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
RAD52P43351 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC17.35■□□□□ 0.37
RAD52P43351 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
RAD52P43351 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
RAD52P43351 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
RAD52P43351 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RAD52P43351 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RAD52P43351 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
RAD52P43351 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
RAD52P43351 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
RAD52P43351 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RAD52P43351 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RAD52P43351 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
RAD52P43351 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
RAD52P43351 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
RAD52P43351 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RAD52P43351 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RAD52P43351 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
RAD52P43351 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RAD52P43351 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RAD52P43351 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
RAD52P43351 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
RAD52P43351 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
RAD52P43351 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
RAD52P43351 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
RAD52P43351 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
RAD52P43351 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
RAD52P43351 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
RAD52P43351 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
RAD52P43351 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
RAD52P43351 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
RAD52P43351 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
RAD52P43351 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
RAD52P43351 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
RAD52P43351 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
RAD52P43351 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
RAD52P43351 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
RAD52P43351 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
RAD52P43351 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
RAD52P43351 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
RAD52P43351 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC17.34■□□□□ 0.37
RAD52P43351 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
RAD52P43351 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
RAD52P43351 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
RAD52P43351 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
RAD52P43351 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
RAD52P43351 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
RAD52P43351 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
RAD52P43351 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
RAD52P43351 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
RAD52P43351 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
RAD52P43351 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
RAD52P43351 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
RAD52P43351 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
RAD52P43351 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
RAD52P43351 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
RAD52P43351 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
RAD52P43351 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
RAD52P43351 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
RAD52P43351 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
RAD52P43351 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
RAD52P43351 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
RAD52P43351 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
RAD52P43351 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
RAD52P43351 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
RAD52P43351 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
RAD52P43351 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
RAD52P43351 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
RAD52P43351 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.9 ms