Protein–RNA interactions for Protein: P43007

SLC1A4, Neutral amino acid transporter A, humanhuman

Predictions only

Length 532 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC1A4P43007 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
SLC1A4P43007 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SLC1A4P43007 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.23
SLC1A4P43007 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SLC1A4P43007 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SLC1A4P43007 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SLC1A4P43007 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SLC1A4P43007 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SLC1A4P43007 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SLC1A4P43007 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
SLC1A4P43007 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SLC1A4P43007 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SLC1A4P43007 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SLC1A4P43007 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
SLC1A4P43007 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SLC1A4P43007 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SLC1A4P43007 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SLC1A4P43007 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
SLC1A4P43007 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SLC1A4P43007 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SLC1A4P43007 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SLC1A4P43007 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SLC1A4P43007 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SLC1A4P43007 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SLC1A4P43007 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SLC1A4P43007 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SLC1A4P43007 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SLC1A4P43007 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SLC1A4P43007 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SLC1A4P43007 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SLC1A4P43007 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SLC1A4P43007 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SLC1A4P43007 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
SLC1A4P43007 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SLC1A4P43007 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SLC1A4P43007 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SLC1A4P43007 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SLC1A4P43007 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SLC1A4P43007 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SLC1A4P43007 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SLC1A4P43007 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SLC1A4P43007 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SLC1A4P43007 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
SLC1A4P43007 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SLC1A4P43007 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
SLC1A4P43007 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SLC1A4P43007 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SLC1A4P43007 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
SLC1A4P43007 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SLC1A4P43007 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SLC1A4P43007 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
SLC1A4P43007 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SLC1A4P43007 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SLC1A4P43007 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SLC1A4P43007 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SLC1A4P43007 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SLC1A4P43007 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SLC1A4P43007 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SLC1A4P43007 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SLC1A4P43007 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SLC1A4P43007 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SLC1A4P43007 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SLC1A4P43007 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
SLC1A4P43007 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SLC1A4P43007 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SLC1A4P43007 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SLC1A4P43007 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SLC1A4P43007 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SLC1A4P43007 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SLC1A4P43007 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
SLC1A4P43007 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SLC1A4P43007 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SLC1A4P43007 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SLC1A4P43007 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SLC1A4P43007 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SLC1A4P43007 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SLC1A4P43007 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
SLC1A4P43007 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SLC1A4P43007 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SLC1A4P43007 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SLC1A4P43007 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SLC1A4P43007 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SLC1A4P43007 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SLC1A4P43007 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
SLC1A4P43007 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SLC1A4P43007 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SLC1A4P43007 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SLC1A4P43007 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SLC1A4P43007 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SLC1A4P43007 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SLC1A4P43007 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SLC1A4P43007 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SLC1A4P43007 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
SLC1A4P43007 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
SLC1A4P43007 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SLC1A4P43007 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SLC1A4P43007 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SLC1A4P43007 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SLC1A4P43007 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SLC1A4P43007 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.9 ms