Protein–RNA interactions for Protein: P42126

ECI1, Enoyl-CoA delta isomerase 1, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 302 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ECI1P42126 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ECI1P42126 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ECI1P42126 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ECI1P42126 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ECI1P42126 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ECI1P42126 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ECI1P42126 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ECI1P42126 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ECI1P42126 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ECI1P42126 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ECI1P42126 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ECI1P42126 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ECI1P42126 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ECI1P42126 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ECI1P42126 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ECI1P42126 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ECI1P42126 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
ECI1P42126 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ECI1P42126 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ECI1P42126 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ECI1P42126 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ECI1P42126 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
ECI1P42126 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ECI1P42126 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ECI1P42126 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ECI1P42126 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ECI1P42126 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ECI1P42126 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ECI1P42126 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ECI1P42126 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ECI1P42126 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ECI1P42126 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ECI1P42126 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ECI1P42126 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ECI1P42126 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ECI1P42126 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ECI1P42126 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ECI1P42126 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ECI1P42126 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ECI1P42126 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ECI1P42126 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ECI1P42126 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ECI1P42126 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ECI1P42126 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ECI1P42126 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ECI1P42126 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ECI1P42126 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ECI1P42126 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ECI1P42126 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ECI1P42126 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ECI1P42126 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ECI1P42126 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ECI1P42126 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ECI1P42126 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ECI1P42126 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ECI1P42126 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ECI1P42126 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ECI1P42126 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ECI1P42126 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ECI1P42126 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ECI1P42126 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ECI1P42126 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ECI1P42126 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ECI1P42126 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ECI1P42126 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ECI1P42126 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ECI1P42126 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ECI1P42126 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ECI1P42126 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ECI1P42126 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ECI1P42126 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ECI1P42126 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ECI1P42126 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
ECI1P42126 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ECI1P42126 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ECI1P42126 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ECI1P42126 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ECI1P42126 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ECI1P42126 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ECI1P42126 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ECI1P42126 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ECI1P42126 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ECI1P42126 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ECI1P42126 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ECI1P42126 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ECI1P42126 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ECI1P42126 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ECI1P42126 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ECI1P42126 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ECI1P42126 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ECI1P42126 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ECI1P42126 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ECI1P42126 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ECI1P42126 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ECI1P42126 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ECI1P42126 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ECI1P42126 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ECI1P42126 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ECI1P42126 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ECI1P42126 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.3 ms