Protein–RNA interactions for Protein: P37198

NUP62, Nuclear pore glycoprotein p62, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 522 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP62P37198 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
NUP62P37198 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
NUP62P37198 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NUP62P37198 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NUP62P37198 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NUP62P37198 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
NUP62P37198 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
NUP62P37198 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
NUP62P37198 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
NUP62P37198 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
NUP62P37198 EIF2AK4-201ENST00000263791 5499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
NUP62P37198 CACNA1G-201ENST00000352832 7848 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NUP62P37198 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NUP62P37198 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NUP62P37198 FRMPD4-201ENST00000380682 8465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NUP62P37198 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NUP62P37198 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NUP62P37198 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
NUP62P37198 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
NUP62P37198 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
NUP62P37198 MON2-213ENST00000552738 5543 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NUP62P37198 SEMA5B-202ENST00000357599 4792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NUP62P37198 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
NUP62P37198 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NUP62P37198 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
NUP62P37198 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
NUP62P37198 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
NUP62P37198 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NUP62P37198 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NUP62P37198 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
NUP62P37198 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
NUP62P37198 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NUP62P37198 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NUP62P37198 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
NUP62P37198 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NUP62P37198 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NUP62P37198 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
NUP62P37198 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NUP62P37198 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
NUP62P37198 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NUP62P37198 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
NUP62P37198 TSPYL5-201ENST00000322128 4491 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
NUP62P37198 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
NUP62P37198 TMEM132E-201ENST00000321639 5631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
NUP62P37198 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NUP62P37198 ASB6-203ENST00000450050 4535 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NUP62P37198 SH3RF1-201ENST00000284637 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NUP62P37198 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
NUP62P37198 DAB2IP-205ENST00000408936 6784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
NUP62P37198 GIGYF1-201ENST00000275732 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NUP62P37198 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
NUP62P37198 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
NUP62P37198 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
NUP62P37198 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
NUP62P37198 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
NUP62P37198 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
NUP62P37198 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
NUP62P37198 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NUP62P37198 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
NUP62P37198 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
NUP62P37198 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NUP62P37198 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NUP62P37198 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
NUP62P37198 FAM184B-201ENST00000265018 6622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NUP62P37198 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NUP62P37198 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NUP62P37198 NFATC4-203ENST00000422617 5491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NUP62P37198 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NUP62P37198 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
NUP62P37198 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
NUP62P37198 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
NUP62P37198 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NUP62P37198 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NUP62P37198 YY1-201ENST00000262238 6697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NUP62P37198 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NUP62P37198 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NUP62P37198 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NUP62P37198 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
NUP62P37198 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NUP62P37198 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NUP62P37198 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
NUP62P37198 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
NUP62P37198 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
NUP62P37198 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NUP62P37198 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NUP62P37198 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
NUP62P37198 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
NUP62P37198 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NUP62P37198 RGS6-210ENST00000553530 5685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NUP62P37198 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
NUP62P37198 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
NUP62P37198 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
NUP62P37198 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
NUP62P37198 CLN5-208ENST00000636183 6664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NUP62P37198 MYO1D-201ENST00000318217 5563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NUP62P37198 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
NUP62P37198 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NUP62P37198 QRICH1-201ENST00000357496 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
NUP62P37198 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
NUP62P37198 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.2 ms