Protein–RNA interactions for Protein: P35606

COPB2, Coatomer subunit beta', humanhuman

Predictions only

Length 906 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPB2P35606 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
COPB2P35606 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
COPB2P35606 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
COPB2P35606 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
COPB2P35606 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
COPB2P35606 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
COPB2P35606 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
COPB2P35606 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
COPB2P35606 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
COPB2P35606 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
COPB2P35606 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
COPB2P35606 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
COPB2P35606 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
COPB2P35606 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
COPB2P35606 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
COPB2P35606 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
COPB2P35606 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
COPB2P35606 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
COPB2P35606 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
COPB2P35606 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
COPB2P35606 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
COPB2P35606 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
COPB2P35606 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
COPB2P35606 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
COPB2P35606 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
COPB2P35606 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
COPB2P35606 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
COPB2P35606 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
COPB2P35606 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.4■■□□□ 1.18
COPB2P35606 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
COPB2P35606 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
COPB2P35606 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
COPB2P35606 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
COPB2P35606 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
COPB2P35606 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
COPB2P35606 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
COPB2P35606 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
COPB2P35606 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
COPB2P35606 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
COPB2P35606 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
COPB2P35606 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
COPB2P35606 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
COPB2P35606 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.18
COPB2P35606 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
COPB2P35606 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
COPB2P35606 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
COPB2P35606 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
COPB2P35606 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
COPB2P35606 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
COPB2P35606 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
COPB2P35606 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
COPB2P35606 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
COPB2P35606 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
COPB2P35606 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
COPB2P35606 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
COPB2P35606 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.39■■□□□ 1.17
COPB2P35606 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
COPB2P35606 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
COPB2P35606 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
COPB2P35606 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
COPB2P35606 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
COPB2P35606 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
COPB2P35606 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
COPB2P35606 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
COPB2P35606 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
COPB2P35606 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
COPB2P35606 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
COPB2P35606 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
COPB2P35606 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC22.38■■□□□ 1.17
COPB2P35606 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
COPB2P35606 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
COPB2P35606 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
COPB2P35606 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
COPB2P35606 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC22.38■■□□□ 1.17
COPB2P35606 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
COPB2P35606 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
COPB2P35606 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
COPB2P35606 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
COPB2P35606 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
COPB2P35606 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
COPB2P35606 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
COPB2P35606 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
COPB2P35606 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
COPB2P35606 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
COPB2P35606 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
COPB2P35606 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
COPB2P35606 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
COPB2P35606 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
COPB2P35606 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
COPB2P35606 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
COPB2P35606 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
COPB2P35606 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
COPB2P35606 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
COPB2P35606 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
COPB2P35606 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
COPB2P35606 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
COPB2P35606 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
COPB2P35606 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
COPB2P35606 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
COPB2P35606 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.6 ms