Protein–RNA interactions for Protein: P35527

KRT9, Keratin, type I cytoskeletal 9, humanhuman

Predictions only

Length 623 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT9P35527 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
KRT9P35527 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
KRT9P35527 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
KRT9P35527 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
KRT9P35527 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
KRT9P35527 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
KRT9P35527 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
KRT9P35527 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
KRT9P35527 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
KRT9P35527 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
KRT9P35527 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
KRT9P35527 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
KRT9P35527 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
KRT9P35527 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
KRT9P35527 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
KRT9P35527 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
KRT9P35527 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
KRT9P35527 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
KRT9P35527 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
KRT9P35527 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
KRT9P35527 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
KRT9P35527 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
KRT9P35527 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
KRT9P35527 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
KRT9P35527 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
KRT9P35527 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
KRT9P35527 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
KRT9P35527 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
KRT9P35527 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
KRT9P35527 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC21.39■■□□□ 1.01
KRT9P35527 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
KRT9P35527 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
KRT9P35527 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
KRT9P35527 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
KRT9P35527 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
KRT9P35527 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
KRT9P35527 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
KRT9P35527 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
KRT9P35527 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
KRT9P35527 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
KRT9P35527 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
KRT9P35527 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
KRT9P35527 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
KRT9P35527 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
KRT9P35527 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
KRT9P35527 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
KRT9P35527 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
KRT9P35527 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
KRT9P35527 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
KRT9P35527 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
KRT9P35527 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
KRT9P35527 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
KRT9P35527 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
KRT9P35527 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
KRT9P35527 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
KRT9P35527 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
KRT9P35527 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
KRT9P35527 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
KRT9P35527 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
KRT9P35527 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
KRT9P35527 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
KRT9P35527 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
KRT9P35527 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC21.38■■□□□ 1.01
KRT9P35527 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
KRT9P35527 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
KRT9P35527 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
KRT9P35527 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
KRT9P35527 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
KRT9P35527 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
KRT9P35527 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
KRT9P35527 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
KRT9P35527 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
KRT9P35527 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
KRT9P35527 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
KRT9P35527 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
KRT9P35527 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
KRT9P35527 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
KRT9P35527 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
KRT9P35527 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
KRT9P35527 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
KRT9P35527 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
KRT9P35527 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
KRT9P35527 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
KRT9P35527 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
KRT9P35527 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
KRT9P35527 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
KRT9P35527 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
KRT9P35527 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
KRT9P35527 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
KRT9P35527 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
KRT9P35527 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
KRT9P35527 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
KRT9P35527 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
KRT9P35527 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
KRT9P35527 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
KRT9P35527 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
KRT9P35527 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
KRT9P35527 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
KRT9P35527 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
KRT9P35527 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.7 ms