Protein–RNA interactions for Protein: P35247

SFTPD, Pulmonary surfactant-associated protein D, humanhuman

Predictions only

Length 375 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFTPDP35247 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SFTPDP35247 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SFTPDP35247 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SFTPDP35247 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SFTPDP35247 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SFTPDP35247 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SFTPDP35247 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SFTPDP35247 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SFTPDP35247 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SFTPDP35247 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SFTPDP35247 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SFTPDP35247 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SFTPDP35247 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SFTPDP35247 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
SFTPDP35247 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SFTPDP35247 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
SFTPDP35247 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SFTPDP35247 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SFTPDP35247 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
SFTPDP35247 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SFTPDP35247 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SFTPDP35247 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SFTPDP35247 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SFTPDP35247 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SFTPDP35247 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SFTPDP35247 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SFTPDP35247 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SFTPDP35247 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
SFTPDP35247 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SFTPDP35247 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SFTPDP35247 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SFTPDP35247 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SFTPDP35247 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
SFTPDP35247 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SFTPDP35247 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
SFTPDP35247 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SFTPDP35247 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SFTPDP35247 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SFTPDP35247 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SFTPDP35247 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SFTPDP35247 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SFTPDP35247 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SFTPDP35247 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SFTPDP35247 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SFTPDP35247 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SFTPDP35247 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SFTPDP35247 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SFTPDP35247 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SFTPDP35247 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SFTPDP35247 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SFTPDP35247 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SFTPDP35247 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SFTPDP35247 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
SFTPDP35247 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SFTPDP35247 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SFTPDP35247 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SFTPDP35247 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SFTPDP35247 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SFTPDP35247 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SFTPDP35247 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SFTPDP35247 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SFTPDP35247 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SFTPDP35247 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SFTPDP35247 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SFTPDP35247 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SFTPDP35247 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SFTPDP35247 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SFTPDP35247 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SFTPDP35247 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SFTPDP35247 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SFTPDP35247 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SFTPDP35247 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SFTPDP35247 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SFTPDP35247 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SFTPDP35247 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SFTPDP35247 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SFTPDP35247 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SFTPDP35247 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SFTPDP35247 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SFTPDP35247 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SFTPDP35247 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SFTPDP35247 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SFTPDP35247 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
SFTPDP35247 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SFTPDP35247 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SFTPDP35247 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SFTPDP35247 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SFTPDP35247 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SFTPDP35247 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SFTPDP35247 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SFTPDP35247 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SFTPDP35247 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SFTPDP35247 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SFTPDP35247 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SFTPDP35247 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SFTPDP35247 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SFTPDP35247 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SFTPDP35247 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SFTPDP35247 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SFTPDP35247 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.4 ms