Protein–RNA interactions for Protein: P35227

PCGF2, Polycomb group RING finger protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 344 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCGF2P35227 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PCGF2P35227 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PCGF2P35227 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PCGF2P35227 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PCGF2P35227 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PCGF2P35227 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PCGF2P35227 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PCGF2P35227 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PCGF2P35227 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PCGF2P35227 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PCGF2P35227 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PCGF2P35227 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PCGF2P35227 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PCGF2P35227 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PCGF2P35227 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PCGF2P35227 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PCGF2P35227 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PCGF2P35227 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PCGF2P35227 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PCGF2P35227 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PCGF2P35227 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PCGF2P35227 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PCGF2P35227 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PCGF2P35227 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PCGF2P35227 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PCGF2P35227 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PCGF2P35227 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PCGF2P35227 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
PCGF2P35227 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PCGF2P35227 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PCGF2P35227 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PCGF2P35227 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PCGF2P35227 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PCGF2P35227 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PCGF2P35227 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PCGF2P35227 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PCGF2P35227 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PCGF2P35227 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PCGF2P35227 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PCGF2P35227 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PCGF2P35227 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PCGF2P35227 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PCGF2P35227 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PCGF2P35227 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PCGF2P35227 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PCGF2P35227 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PCGF2P35227 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PCGF2P35227 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PCGF2P35227 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PCGF2P35227 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PCGF2P35227 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PCGF2P35227 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PCGF2P35227 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PCGF2P35227 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PCGF2P35227 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PCGF2P35227 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PCGF2P35227 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PCGF2P35227 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PCGF2P35227 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PCGF2P35227 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PCGF2P35227 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PCGF2P35227 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PCGF2P35227 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PCGF2P35227 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PCGF2P35227 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PCGF2P35227 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PCGF2P35227 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PCGF2P35227 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PCGF2P35227 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PCGF2P35227 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PCGF2P35227 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PCGF2P35227 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PCGF2P35227 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PCGF2P35227 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
PCGF2P35227 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PCGF2P35227 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PCGF2P35227 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PCGF2P35227 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PCGF2P35227 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PCGF2P35227 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PCGF2P35227 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PCGF2P35227 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PCGF2P35227 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PCGF2P35227 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PCGF2P35227 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PCGF2P35227 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PCGF2P35227 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PCGF2P35227 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PCGF2P35227 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PCGF2P35227 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
PCGF2P35227 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PCGF2P35227 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PCGF2P35227 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
PCGF2P35227 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
PCGF2P35227 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PCGF2P35227 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PCGF2P35227 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PCGF2P35227 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PCGF2P35227 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PCGF2P35227 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.6 ms