Protein–RNA interactions for Protein: P33992

MCM5, DNA replication licensing factor MCM5, humanhuman

Predictions only

Length 734 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCM5P33992 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
MCM5P33992 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
MCM5P33992 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
MCM5P33992 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
MCM5P33992 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
MCM5P33992 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
MCM5P33992 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
MCM5P33992 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
MCM5P33992 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
MCM5P33992 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
MCM5P33992 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
MCM5P33992 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
MCM5P33992 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
MCM5P33992 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
MCM5P33992 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
MCM5P33992 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
MCM5P33992 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
MCM5P33992 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
MCM5P33992 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
MCM5P33992 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
MCM5P33992 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
MCM5P33992 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
MCM5P33992 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
MCM5P33992 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
MCM5P33992 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
MCM5P33992 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
MCM5P33992 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
MCM5P33992 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
MCM5P33992 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
MCM5P33992 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
MCM5P33992 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
MCM5P33992 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
MCM5P33992 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
MCM5P33992 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
MCM5P33992 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC23.27■■□□□ 1.32
MCM5P33992 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
MCM5P33992 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
MCM5P33992 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
MCM5P33992 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
MCM5P33992 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
MCM5P33992 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
MCM5P33992 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
MCM5P33992 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
MCM5P33992 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
MCM5P33992 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
MCM5P33992 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
MCM5P33992 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
MCM5P33992 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
MCM5P33992 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
MCM5P33992 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
MCM5P33992 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
MCM5P33992 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
MCM5P33992 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
MCM5P33992 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
MCM5P33992 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
MCM5P33992 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
MCM5P33992 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
MCM5P33992 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
MCM5P33992 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
MCM5P33992 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
MCM5P33992 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
MCM5P33992 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
MCM5P33992 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
MCM5P33992 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
MCM5P33992 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
MCM5P33992 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
MCM5P33992 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
MCM5P33992 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
MCM5P33992 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
MCM5P33992 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
MCM5P33992 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
MCM5P33992 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
MCM5P33992 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
MCM5P33992 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
MCM5P33992 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
MCM5P33992 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
MCM5P33992 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
MCM5P33992 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
MCM5P33992 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
MCM5P33992 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
MCM5P33992 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
MCM5P33992 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
MCM5P33992 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
MCM5P33992 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
MCM5P33992 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
MCM5P33992 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
MCM5P33992 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
MCM5P33992 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
MCM5P33992 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
MCM5P33992 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
MCM5P33992 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
MCM5P33992 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
MCM5P33992 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
MCM5P33992 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
MCM5P33992 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
MCM5P33992 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
MCM5P33992 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
MCM5P33992 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
MCM5P33992 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
MCM5P33992 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.9 ms