Protein–RNA interactions for Protein: P31327

CPS1, Carbamoyl-phosphate synthase [ammonia], mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 1,500 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CPS1P31327 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
CPS1P31327 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
CPS1P31327 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
CPS1P31327 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
CPS1P31327 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC27.82■■■□□ 2.04
CPS1P31327 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC27.82■■■□□ 2.04
CPS1P31327 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
CPS1P31327 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
CPS1P31327 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC27.82■■■□□ 2.04
CPS1P31327 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
CPS1P31327 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
CPS1P31327 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
CPS1P31327 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
CPS1P31327 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC27.81■■■□□ 2.04
CPS1P31327 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
CPS1P31327 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
CPS1P31327 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC27.81■■■□□ 2.04
CPS1P31327 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC27.81■■■□□ 2.04
CPS1P31327 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC27.81■■■□□ 2.04
CPS1P31327 AC139530.3-201ENST00000620344 690 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
CPS1P31327 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
CPS1P31327 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
CPS1P31327 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
CPS1P31327 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
CPS1P31327 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
CPS1P31327 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC27.8■■■□□ 2.04
CPS1P31327 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC27.8■■■□□ 2.04
CPS1P31327 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
CPS1P31327 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
CPS1P31327 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
CPS1P31327 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
CPS1P31327 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
CPS1P31327 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
CPS1P31327 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
CPS1P31327 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
CPS1P31327 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
CPS1P31327 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
CPS1P31327 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
CPS1P31327 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
CPS1P31327 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
CPS1P31327 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC27.79■■■□□ 2.04
CPS1P31327 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC27.79■■■□□ 2.04
CPS1P31327 AL671883.3-201ENST00000603274 991 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
CPS1P31327 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.79■■■□□ 2.04
CPS1P31327 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
CPS1P31327 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.79■■■□□ 2.04
CPS1P31327 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
CPS1P31327 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
CPS1P31327 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
CPS1P31327 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
CPS1P31327 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
CPS1P31327 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
CPS1P31327 NTMT1-205ENST00000459968 1123 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
CPS1P31327 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
CPS1P31327 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
CPS1P31327 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
CPS1P31327 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
CPS1P31327 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC27.78■■■□□ 2.04
CPS1P31327 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC27.78■■■□□ 2.04
CPS1P31327 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
CPS1P31327 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
CPS1P31327 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
CPS1P31327 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
CPS1P31327 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
CPS1P31327 AC099811.2-203ENST00000592574 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
CPS1P31327 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
CPS1P31327 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
CPS1P31327 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
CPS1P31327 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
CPS1P31327 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
CPS1P31327 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
CPS1P31327 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
CPS1P31327 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
CPS1P31327 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
CPS1P31327 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
CPS1P31327 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
CPS1P31327 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
CPS1P31327 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
CPS1P31327 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.04
CPS1P31327 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
CPS1P31327 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
CPS1P31327 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
CPS1P31327 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
CPS1P31327 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
CPS1P31327 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
CPS1P31327 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
CPS1P31327 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
CPS1P31327 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
CPS1P31327 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
CPS1P31327 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
CPS1P31327 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
CPS1P31327 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
CPS1P31327 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
CPS1P31327 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
CPS1P31327 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
CPS1P31327 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
CPS1P31327 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
CPS1P31327 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
CPS1P31327 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
CPS1P31327 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.5 ms