Protein–RNA interactions for Protein: P31275

HOXC12, Homeobox protein Hox-C12, humanhuman

Predictions only

Length 282 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC12P31275 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
HOXC12P31275 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
HOXC12P31275 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
HOXC12P31275 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
HOXC12P31275 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
HOXC12P31275 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
HOXC12P31275 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
HOXC12P31275 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
HOXC12P31275 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
HOXC12P31275 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
HOXC12P31275 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
HOXC12P31275 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
HOXC12P31275 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
HOXC12P31275 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
HOXC12P31275 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
HOXC12P31275 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
HOXC12P31275 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
HOXC12P31275 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
HOXC12P31275 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
HOXC12P31275 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
HOXC12P31275 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
HOXC12P31275 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
HOXC12P31275 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
HOXC12P31275 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
HOXC12P31275 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
HOXC12P31275 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
HOXC12P31275 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
HOXC12P31275 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
HOXC12P31275 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
HOXC12P31275 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
HOXC12P31275 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
HOXC12P31275 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
HOXC12P31275 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
HOXC12P31275 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
HOXC12P31275 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
HOXC12P31275 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
HOXC12P31275 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
HOXC12P31275 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
HOXC12P31275 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
HOXC12P31275 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
HOXC12P31275 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
HOXC12P31275 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
HOXC12P31275 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
HOXC12P31275 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
HOXC12P31275 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
HOXC12P31275 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
HOXC12P31275 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
HOXC12P31275 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
HOXC12P31275 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
HOXC12P31275 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
HOXC12P31275 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
HOXC12P31275 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
HOXC12P31275 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
HOXC12P31275 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
HOXC12P31275 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
HOXC12P31275 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
HOXC12P31275 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
HOXC12P31275 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
HOXC12P31275 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
HOXC12P31275 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
HOXC12P31275 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
HOXC12P31275 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
HOXC12P31275 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
HOXC12P31275 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
HOXC12P31275 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
HOXC12P31275 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
HOXC12P31275 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
HOXC12P31275 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
HOXC12P31275 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
HOXC12P31275 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
HOXC12P31275 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
HOXC12P31275 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
HOXC12P31275 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
HOXC12P31275 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
HOXC12P31275 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
HOXC12P31275 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
HOXC12P31275 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
HOXC12P31275 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
HOXC12P31275 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
HOXC12P31275 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
HOXC12P31275 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
HOXC12P31275 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
HOXC12P31275 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
HOXC12P31275 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
HOXC12P31275 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
HOXC12P31275 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
HOXC12P31275 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
HOXC12P31275 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
HOXC12P31275 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
HOXC12P31275 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
HOXC12P31275 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
HOXC12P31275 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
HOXC12P31275 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
HOXC12P31275 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
HOXC12P31275 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
HOXC12P31275 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
HOXC12P31275 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
HOXC12P31275 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
HOXC12P31275 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
HOXC12P31275 HGNC:18790-203ENST00000433139 2254 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.1 ms