Protein–RNA interactions for Protein: P29973

CNGA1, cGMP-gated cation channel alpha-1, humanhuman

Predictions only

Length 690 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNGA1P29973 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CNGA1P29973 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CNGA1P29973 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CNGA1P29973 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CNGA1P29973 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CNGA1P29973 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CNGA1P29973 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CNGA1P29973 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CNGA1P29973 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CNGA1P29973 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
CNGA1P29973 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
CNGA1P29973 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CNGA1P29973 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CNGA1P29973 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CNGA1P29973 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CNGA1P29973 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CNGA1P29973 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CNGA1P29973 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CNGA1P29973 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CNGA1P29973 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CNGA1P29973 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CNGA1P29973 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CNGA1P29973 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CNGA1P29973 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CNGA1P29973 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CNGA1P29973 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CNGA1P29973 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CNGA1P29973 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CNGA1P29973 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
CNGA1P29973 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CNGA1P29973 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CNGA1P29973 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CNGA1P29973 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CNGA1P29973 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CNGA1P29973 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CNGA1P29973 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CNGA1P29973 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CNGA1P29973 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CNGA1P29973 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CNGA1P29973 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CNGA1P29973 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CNGA1P29973 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CNGA1P29973 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CNGA1P29973 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
CNGA1P29973 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CNGA1P29973 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CNGA1P29973 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CNGA1P29973 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CNGA1P29973 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CNGA1P29973 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CNGA1P29973 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CNGA1P29973 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CNGA1P29973 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CNGA1P29973 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CNGA1P29973 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CNGA1P29973 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CNGA1P29973 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CNGA1P29973 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CNGA1P29973 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CNGA1P29973 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CNGA1P29973 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CNGA1P29973 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CNGA1P29973 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CNGA1P29973 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CNGA1P29973 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CNGA1P29973 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CNGA1P29973 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CNGA1P29973 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
CNGA1P29973 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
CNGA1P29973 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CNGA1P29973 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CNGA1P29973 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CNGA1P29973 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CNGA1P29973 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CNGA1P29973 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CNGA1P29973 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CNGA1P29973 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CNGA1P29973 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CNGA1P29973 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CNGA1P29973 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CNGA1P29973 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CNGA1P29973 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CNGA1P29973 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CNGA1P29973 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CNGA1P29973 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CNGA1P29973 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CNGA1P29973 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CNGA1P29973 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CNGA1P29973 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CNGA1P29973 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
CNGA1P29973 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CNGA1P29973 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CNGA1P29973 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CNGA1P29973 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CNGA1P29973 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CNGA1P29973 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CNGA1P29973 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CNGA1P29973 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CNGA1P29973 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
CNGA1P29973 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.2 ms