Protein–RNA interactions for Protein: P29965

CD40LG, CD40 ligand, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD40LGP29965 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
CD40LGP29965 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.37
CD40LGP29965 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
CD40LGP29965 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CD40LGP29965 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CD40LGP29965 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CD40LGP29965 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CD40LGP29965 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CD40LGP29965 ICA1-201ENST00000265577 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CD40LGP29965 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CD40LGP29965 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CD40LGP29965 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CD40LGP29965 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CD40LGP29965 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CD40LGP29965 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CD40LGP29965 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CD40LGP29965 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CD40LGP29965 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CD40LGP29965 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CD40LGP29965 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
CD40LGP29965 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CD40LGP29965 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CD40LGP29965 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CD40LGP29965 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CD40LGP29965 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CD40LGP29965 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CD40LGP29965 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CD40LGP29965 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
CD40LGP29965 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
CD40LGP29965 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CD40LGP29965 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
CD40LGP29965 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CD40LGP29965 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CD40LGP29965 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CD40LGP29965 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
CD40LGP29965 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CD40LGP29965 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CD40LGP29965 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CD40LGP29965 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CD40LGP29965 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
CD40LGP29965 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CD40LGP29965 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CD40LGP29965 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CD40LGP29965 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CD40LGP29965 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CD40LGP29965 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
CD40LGP29965 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CD40LGP29965 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CD40LGP29965 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CD40LGP29965 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CD40LGP29965 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CD40LGP29965 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CD40LGP29965 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CD40LGP29965 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CD40LGP29965 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CD40LGP29965 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
CD40LGP29965 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CD40LGP29965 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CD40LGP29965 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
CD40LGP29965 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CD40LGP29965 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CD40LGP29965 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CD40LGP29965 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CD40LGP29965 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CD40LGP29965 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CD40LGP29965 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CD40LGP29965 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CD40LGP29965 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CD40LGP29965 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CD40LGP29965 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CD40LGP29965 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CD40LGP29965 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CD40LGP29965 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CD40LGP29965 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CD40LGP29965 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CD40LGP29965 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CD40LGP29965 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CD40LGP29965 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CD40LGP29965 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CD40LGP29965 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CD40LGP29965 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CD40LGP29965 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CD40LGP29965 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CD40LGP29965 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CD40LGP29965 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CD40LGP29965 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CD40LGP29965 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CD40LGP29965 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CD40LGP29965 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CD40LGP29965 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CD40LGP29965 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CD40LGP29965 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CD40LGP29965 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CD40LGP29965 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
CD40LGP29965 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CD40LGP29965 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CD40LGP29965 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CD40LGP29965 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CD40LGP29965 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CD40LGP29965 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.2 ms