Protein–RNA interactions for Protein: P28562

DUSP1, Dual specificity protein phosphatase 1, humanhuman

Predictions only

Length 367 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUSP1P28562 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
DUSP1P28562 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
DUSP1P28562 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
DUSP1P28562 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC16.7■□□□□ 0.26
DUSP1P28562 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
DUSP1P28562 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
DUSP1P28562 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
DUSP1P28562 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
DUSP1P28562 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
DUSP1P28562 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
DUSP1P28562 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
DUSP1P28562 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
DUSP1P28562 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
DUSP1P28562 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
DUSP1P28562 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
DUSP1P28562 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
DUSP1P28562 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
DUSP1P28562 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
DUSP1P28562 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
DUSP1P28562 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
DUSP1P28562 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
DUSP1P28562 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
DUSP1P28562 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
DUSP1P28562 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
DUSP1P28562 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
DUSP1P28562 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
DUSP1P28562 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
DUSP1P28562 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
DUSP1P28562 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
DUSP1P28562 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
DUSP1P28562 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
DUSP1P28562 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
DUSP1P28562 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
DUSP1P28562 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
DUSP1P28562 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
DUSP1P28562 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
DUSP1P28562 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
DUSP1P28562 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
DUSP1P28562 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
DUSP1P28562 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
DUSP1P28562 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
DUSP1P28562 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
DUSP1P28562 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
DUSP1P28562 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
DUSP1P28562 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
DUSP1P28562 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
DUSP1P28562 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
DUSP1P28562 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
DUSP1P28562 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
DUSP1P28562 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
DUSP1P28562 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
DUSP1P28562 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
DUSP1P28562 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
DUSP1P28562 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
DUSP1P28562 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
DUSP1P28562 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
DUSP1P28562 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
DUSP1P28562 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
DUSP1P28562 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
DUSP1P28562 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
DUSP1P28562 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
DUSP1P28562 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
DUSP1P28562 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
DUSP1P28562 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
DUSP1P28562 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
DUSP1P28562 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
DUSP1P28562 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
DUSP1P28562 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
DUSP1P28562 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
DUSP1P28562 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
DUSP1P28562 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
DUSP1P28562 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
DUSP1P28562 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
DUSP1P28562 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
DUSP1P28562 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
DUSP1P28562 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
DUSP1P28562 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
DUSP1P28562 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
DUSP1P28562 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
DUSP1P28562 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
DUSP1P28562 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
DUSP1P28562 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
DUSP1P28562 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
DUSP1P28562 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
DUSP1P28562 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
DUSP1P28562 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
DUSP1P28562 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
DUSP1P28562 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
DUSP1P28562 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
DUSP1P28562 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
DUSP1P28562 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
DUSP1P28562 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
DUSP1P28562 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
DUSP1P28562 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
DUSP1P28562 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
DUSP1P28562 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
DUSP1P28562 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
DUSP1P28562 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
DUSP1P28562 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
DUSP1P28562 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.4 ms