Protein–RNA interactions for Protein: P28300

LOX, Protein-lysine 6-oxidase, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LOXP28300 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
LOXP28300 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
LOXP28300 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
LOXP28300 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
LOXP28300 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC16.79■□□□□ 0.28
LOXP28300 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
LOXP28300 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
LOXP28300 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
LOXP28300 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
LOXP28300 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
LOXP28300 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
LOXP28300 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
LOXP28300 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
LOXP28300 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
LOXP28300 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
LOXP28300 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
LOXP28300 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
LOXP28300 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
LOXP28300 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
LOXP28300 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
LOXP28300 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
LOXP28300 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
LOXP28300 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
LOXP28300 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
LOXP28300 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
LOXP28300 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
LOXP28300 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
LOXP28300 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
LOXP28300 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
LOXP28300 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
LOXP28300 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
LOXP28300 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
LOXP28300 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
LOXP28300 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
LOXP28300 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
LOXP28300 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
LOXP28300 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
LOXP28300 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
LOXP28300 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
LOXP28300 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
LOXP28300 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
LOXP28300 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
LOXP28300 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
LOXP28300 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
LOXP28300 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
LOXP28300 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
LOXP28300 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
LOXP28300 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
LOXP28300 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
LOXP28300 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
LOXP28300 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
LOXP28300 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
LOXP28300 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
LOXP28300 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
LOXP28300 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
LOXP28300 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
LOXP28300 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
LOXP28300 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
LOXP28300 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
LOXP28300 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
LOXP28300 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
LOXP28300 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
LOXP28300 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
LOXP28300 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
LOXP28300 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
LOXP28300 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
LOXP28300 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
LOXP28300 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
LOXP28300 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
LOXP28300 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
LOXP28300 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
LOXP28300 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
LOXP28300 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
LOXP28300 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
LOXP28300 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC16.77■□□□□ 0.28
LOXP28300 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
LOXP28300 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
LOXP28300 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
LOXP28300 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
LOXP28300 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
LOXP28300 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
LOXP28300 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
LOXP28300 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
LOXP28300 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
LOXP28300 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
LOXP28300 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
LOXP28300 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
LOXP28300 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
LOXP28300 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
LOXP28300 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
LOXP28300 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
LOXP28300 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
LOXP28300 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
LOXP28300 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
LOXP28300 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
LOXP28300 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
LOXP28300 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
LOXP28300 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
LOXP28300 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
LOXP28300 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.3 ms