Protein–RNA interactions for Protein: P28067

HLA-DMA, HLA class II histocompatibility antigen, DM alpha chain, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-DMAP28067 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
HLA-DMAP28067 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
HLA-DMAP28067 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
HLA-DMAP28067 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
HLA-DMAP28067 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
HLA-DMAP28067 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
HLA-DMAP28067 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
HLA-DMAP28067 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
HLA-DMAP28067 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
HLA-DMAP28067 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
HLA-DMAP28067 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
HLA-DMAP28067 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
HLA-DMAP28067 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
HLA-DMAP28067 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
HLA-DMAP28067 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
HLA-DMAP28067 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
HLA-DMAP28067 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
HLA-DMAP28067 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
HLA-DMAP28067 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
HLA-DMAP28067 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
HLA-DMAP28067 CENPT-208ENST00000562787 2345 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
HLA-DMAP28067 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
HLA-DMAP28067 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
HLA-DMAP28067 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
HLA-DMAP28067 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
HLA-DMAP28067 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
HLA-DMAP28067 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
HLA-DMAP28067 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
HLA-DMAP28067 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
HLA-DMAP28067 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
HLA-DMAP28067 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
HLA-DMAP28067 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
HLA-DMAP28067 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
HLA-DMAP28067 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
HLA-DMAP28067 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
HLA-DMAP28067 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
HLA-DMAP28067 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
HLA-DMAP28067 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
HLA-DMAP28067 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
HLA-DMAP28067 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
HLA-DMAP28067 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
HLA-DMAP28067 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
HLA-DMAP28067 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
HLA-DMAP28067 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
HLA-DMAP28067 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
HLA-DMAP28067 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
HLA-DMAP28067 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
HLA-DMAP28067 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
HLA-DMAP28067 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
HLA-DMAP28067 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
HLA-DMAP28067 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
HLA-DMAP28067 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
HLA-DMAP28067 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
HLA-DMAP28067 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
HLA-DMAP28067 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
HLA-DMAP28067 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
HLA-DMAP28067 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
HLA-DMAP28067 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
HLA-DMAP28067 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
HLA-DMAP28067 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
HLA-DMAP28067 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
HLA-DMAP28067 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
HLA-DMAP28067 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
HLA-DMAP28067 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
HLA-DMAP28067 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
HLA-DMAP28067 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
HLA-DMAP28067 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
HLA-DMAP28067 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
HLA-DMAP28067 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
HLA-DMAP28067 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC16.92■□□□□ 0.3
HLA-DMAP28067 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
HLA-DMAP28067 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
HLA-DMAP28067 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
HLA-DMAP28067 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
HLA-DMAP28067 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC16.92■□□□□ 0.3
HLA-DMAP28067 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
HLA-DMAP28067 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
HLA-DMAP28067 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
HLA-DMAP28067 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC16.92■□□□□ 0.3
HLA-DMAP28067 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
HLA-DMAP28067 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
HLA-DMAP28067 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
HLA-DMAP28067 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
HLA-DMAP28067 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
HLA-DMAP28067 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
HLA-DMAP28067 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
HLA-DMAP28067 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
HLA-DMAP28067 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
HLA-DMAP28067 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
HLA-DMAP28067 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
HLA-DMAP28067 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
HLA-DMAP28067 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
HLA-DMAP28067 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
HLA-DMAP28067 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
HLA-DMAP28067 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
HLA-DMAP28067 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
HLA-DMAP28067 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
HLA-DMAP28067 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
HLA-DMAP28067 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
HLA-DMAP28067 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.8 ms