Protein–RNA interactions for Protein: P24864

CCNE1, G1/S-specific cyclin-E1, humanhuman

Predictions only

Length 410 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNE1P24864 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CCNE1P24864 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CCNE1P24864 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CCNE1P24864 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CCNE1P24864 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CCNE1P24864 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CCNE1P24864 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CCNE1P24864 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CCNE1P24864 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CCNE1P24864 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CCNE1P24864 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CCNE1P24864 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CCNE1P24864 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CCNE1P24864 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CCNE1P24864 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CCNE1P24864 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CCNE1P24864 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CCNE1P24864 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CCNE1P24864 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CCNE1P24864 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CCNE1P24864 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CCNE1P24864 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CCNE1P24864 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CCNE1P24864 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CCNE1P24864 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
CCNE1P24864 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CCNE1P24864 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CCNE1P24864 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CCNE1P24864 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CCNE1P24864 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CCNE1P24864 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
CCNE1P24864 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CCNE1P24864 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CCNE1P24864 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
CCNE1P24864 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CCNE1P24864 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CCNE1P24864 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CCNE1P24864 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CCNE1P24864 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CCNE1P24864 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CCNE1P24864 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CCNE1P24864 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CCNE1P24864 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CCNE1P24864 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CCNE1P24864 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CCNE1P24864 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CCNE1P24864 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CCNE1P24864 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CCNE1P24864 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CCNE1P24864 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CCNE1P24864 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CCNE1P24864 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CCNE1P24864 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CCNE1P24864 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CCNE1P24864 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CCNE1P24864 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CCNE1P24864 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CCNE1P24864 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CCNE1P24864 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CCNE1P24864 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CCNE1P24864 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CCNE1P24864 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CCNE1P24864 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CCNE1P24864 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CCNE1P24864 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CCNE1P24864 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCNE1P24864 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCNE1P24864 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCNE1P24864 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCNE1P24864 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCNE1P24864 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
CCNE1P24864 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCNE1P24864 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCNE1P24864 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCNE1P24864 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCNE1P24864 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCNE1P24864 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCNE1P24864 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCNE1P24864 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCNE1P24864 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCNE1P24864 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCNE1P24864 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCNE1P24864 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCNE1P24864 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCNE1P24864 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCNE1P24864 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
CCNE1P24864 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCNE1P24864 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCNE1P24864 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCNE1P24864 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCNE1P24864 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCNE1P24864 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCNE1P24864 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCNE1P24864 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCNE1P24864 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCNE1P24864 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCNE1P24864 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCNE1P24864 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCNE1P24864 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCNE1P24864 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.1 ms