Protein–RNA interactions for Protein: P21127

CDK11B, Cyclin-dependent kinase 11B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 795 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK11BP21127 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CDK11BP21127 FAM46A-201ENST00000320172 5609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CDK11BP21127 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CDK11BP21127 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CDK11BP21127 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CDK11BP21127 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CDK11BP21127 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CDK11BP21127 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CDK11BP21127 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CDK11BP21127 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CDK11BP21127 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CDK11BP21127 COBL-201ENST00000265136 5291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CDK11BP21127 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CDK11BP21127 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CDK11BP21127 MON2-203ENST00000546600 6130 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CDK11BP21127 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CDK11BP21127 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CDK11BP21127 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CDK11BP21127 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CDK11BP21127 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CDK11BP21127 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CDK11BP21127 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CDK11BP21127 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
CDK11BP21127 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CDK11BP21127 SCRIB-202ENST00000356994 5218 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CDK11BP21127 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CDK11BP21127 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CDK11BP21127 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
CDK11BP21127 UCHL5-206ENST00000367455 5327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CDK11BP21127 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CDK11BP21127 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CDK11BP21127 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CDK11BP21127 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CDK11BP21127 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CDK11BP21127 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CDK11BP21127 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CDK11BP21127 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CDK11BP21127 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CDK11BP21127 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CDK11BP21127 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
CDK11BP21127 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
CDK11BP21127 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CDK11BP21127 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
CDK11BP21127 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CDK11BP21127 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CDK11BP21127 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
CDK11BP21127 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CDK11BP21127 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CDK11BP21127 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CDK11BP21127 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CDK11BP21127 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
CDK11BP21127 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
CDK11BP21127 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
CDK11BP21127 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CDK11BP21127 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CDK11BP21127 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CDK11BP21127 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CDK11BP21127 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CDK11BP21127 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CDK11BP21127 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CDK11BP21127 NFATC2-206ENST00000609943 5690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CDK11BP21127 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CDK11BP21127 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
CDK11BP21127 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CDK11BP21127 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CDK11BP21127 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CDK11BP21127 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CDK11BP21127 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CDK11BP21127 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CDK11BP21127 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CDK11BP21127 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CDK11BP21127 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CDK11BP21127 ZFP3-201ENST00000318833 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CDK11BP21127 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CDK11BP21127 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CDK11BP21127 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CDK11BP21127 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CDK11BP21127 ZBTB7C-221ENST00000590800 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CDK11BP21127 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CDK11BP21127 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CDK11BP21127 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CDK11BP21127 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CDK11BP21127 SOCS2-212ENST00000622746 2881 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CDK11BP21127 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CDK11BP21127 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CDK11BP21127 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CDK11BP21127 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CDK11BP21127 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CDK11BP21127 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CDK11BP21127 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CDK11BP21127 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
CDK11BP21127 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CDK11BP21127 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CDK11BP21127 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CDK11BP21127 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
CDK11BP21127 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CDK11BP21127 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CDK11BP21127 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CDK11BP21127 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CDK11BP21127 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.6 ms