Protein–RNA interactions for Protein: P20827

EFNA1, Ephrin-A1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFNA1P20827 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.58
EFNA1P20827 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
EFNA1P20827 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.58
EFNA1P20827 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.58
EFNA1P20827 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
EFNA1P20827 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
EFNA1P20827 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
EFNA1P20827 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
EFNA1P20827 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
EFNA1P20827 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC18.64■□□□□ 0.57
EFNA1P20827 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
EFNA1P20827 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
EFNA1P20827 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
EFNA1P20827 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
EFNA1P20827 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
EFNA1P20827 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
EFNA1P20827 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
EFNA1P20827 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
EFNA1P20827 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
EFNA1P20827 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
EFNA1P20827 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
EFNA1P20827 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
EFNA1P20827 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
EFNA1P20827 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
EFNA1P20827 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
EFNA1P20827 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
EFNA1P20827 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
EFNA1P20827 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
EFNA1P20827 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
EFNA1P20827 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
EFNA1P20827 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
EFNA1P20827 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
EFNA1P20827 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
EFNA1P20827 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
EFNA1P20827 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
EFNA1P20827 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
EFNA1P20827 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
EFNA1P20827 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
EFNA1P20827 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
EFNA1P20827 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
EFNA1P20827 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
EFNA1P20827 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
EFNA1P20827 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
EFNA1P20827 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
EFNA1P20827 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
EFNA1P20827 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
EFNA1P20827 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
EFNA1P20827 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
EFNA1P20827 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
EFNA1P20827 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
EFNA1P20827 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
EFNA1P20827 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
EFNA1P20827 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
EFNA1P20827 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
EFNA1P20827 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC18.62■□□□□ 0.57
EFNA1P20827 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
EFNA1P20827 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
EFNA1P20827 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
EFNA1P20827 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
EFNA1P20827 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
EFNA1P20827 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
EFNA1P20827 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
EFNA1P20827 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
EFNA1P20827 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
EFNA1P20827 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
EFNA1P20827 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
EFNA1P20827 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
EFNA1P20827 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
EFNA1P20827 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
EFNA1P20827 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
EFNA1P20827 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
EFNA1P20827 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
EFNA1P20827 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
EFNA1P20827 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
EFNA1P20827 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.61■□□□□ 0.57
EFNA1P20827 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
EFNA1P20827 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
EFNA1P20827 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
EFNA1P20827 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
EFNA1P20827 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
EFNA1P20827 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
EFNA1P20827 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
EFNA1P20827 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
EFNA1P20827 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
EFNA1P20827 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
EFNA1P20827 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
EFNA1P20827 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
EFNA1P20827 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
EFNA1P20827 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
EFNA1P20827 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
EFNA1P20827 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
EFNA1P20827 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
EFNA1P20827 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
EFNA1P20827 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
EFNA1P20827 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
EFNA1P20827 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
EFNA1P20827 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
EFNA1P20827 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
EFNA1P20827 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
EFNA1P20827 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34 ms