Protein–RNA interactions for Protein: P20719

HOXA5, Homeobox protein Hox-A5, humanhuman

Predictions only

Length 270 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA5P20719 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
HOXA5P20719 ZNF710-201ENST00000268154 4617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
HOXA5P20719 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
HOXA5P20719 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
HOXA5P20719 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
HOXA5P20719 AC131160.1-201ENST00000639401 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
HOXA5P20719 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
HOXA5P20719 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
HOXA5P20719 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
HOXA5P20719 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
HOXA5P20719 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
HOXA5P20719 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
HOXA5P20719 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
HOXA5P20719 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
HOXA5P20719 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
HOXA5P20719 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
HOXA5P20719 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
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HOXA5P20719 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
HOXA5P20719 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
HOXA5P20719 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
HOXA5P20719 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
HOXA5P20719 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
HOXA5P20719 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
HOXA5P20719 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
HOXA5P20719 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
HOXA5P20719 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
HOXA5P20719 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
HOXA5P20719 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
HOXA5P20719 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
HOXA5P20719 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
HOXA5P20719 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
HOXA5P20719 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
HOXA5P20719 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
HOXA5P20719 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
HOXA5P20719 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
HOXA5P20719 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
HOXA5P20719 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
HOXA5P20719 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
HOXA5P20719 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
HOXA5P20719 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
HOXA5P20719 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
HOXA5P20719 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
HOXA5P20719 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
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HOXA5P20719 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
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HOXA5P20719 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
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HOXA5P20719 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
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HOXA5P20719 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
HOXA5P20719 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
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HOXA5P20719 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
HOXA5P20719 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
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HOXA5P20719 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
HOXA5P20719 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
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HOXA5P20719 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
HOXA5P20719 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
HOXA5P20719 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
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HOXA5P20719 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
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HOXA5P20719 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
HOXA5P20719 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
HOXA5P20719 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
HOXA5P20719 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
HOXA5P20719 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
HOXA5P20719 JRK-211ENST00000615982 2823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
HOXA5P20719 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
HOXA5P20719 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
HOXA5P20719 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
HOXA5P20719 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
HOXA5P20719 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
HOXA5P20719 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
HOXA5P20719 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
HOXA5P20719 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
HOXA5P20719 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
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