Protein–RNA interactions for Protein: P20132

SDS, L-serine dehydratase/L-threonine deaminase, humanhuman

Predictions only

Length 328 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SDSP20132 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SDSP20132 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SDSP20132 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SDSP20132 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SDSP20132 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SDSP20132 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SDSP20132 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SDSP20132 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SDSP20132 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SDSP20132 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SDSP20132 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SDSP20132 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SDSP20132 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SDSP20132 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SDSP20132 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SDSP20132 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SDSP20132 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SDSP20132 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SDSP20132 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SDSP20132 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SDSP20132 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SDSP20132 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SDSP20132 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SDSP20132 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SDSP20132 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SDSP20132 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SDSP20132 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
SDSP20132 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SDSP20132 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SDSP20132 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SDSP20132 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SDSP20132 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SDSP20132 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SDSP20132 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SDSP20132 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SDSP20132 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SDSP20132 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SDSP20132 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SDSP20132 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SDSP20132 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SDSP20132 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SDSP20132 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SDSP20132 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SDSP20132 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SDSP20132 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SDSP20132 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SDSP20132 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SDSP20132 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SDSP20132 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SDSP20132 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SDSP20132 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SDSP20132 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SDSP20132 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SDSP20132 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SDSP20132 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SDSP20132 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SDSP20132 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SDSP20132 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SDSP20132 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SDSP20132 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SDSP20132 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
SDSP20132 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SDSP20132 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SDSP20132 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SDSP20132 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SDSP20132 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SDSP20132 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SDSP20132 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SDSP20132 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SDSP20132 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
SDSP20132 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
SDSP20132 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SDSP20132 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SDSP20132 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SDSP20132 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SDSP20132 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SDSP20132 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SDSP20132 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SDSP20132 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
SDSP20132 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
SDSP20132 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.4
SDSP20132 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC23.83■■□□□ 1.4
SDSP20132 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SDSP20132 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SDSP20132 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
SDSP20132 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
SDSP20132 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SDSP20132 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
SDSP20132 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
SDSP20132 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
SDSP20132 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SDSP20132 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SDSP20132 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
SDSP20132 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
SDSP20132 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
SDSP20132 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
SDSP20132 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.82■■□□□ 1.4
SDSP20132 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
SDSP20132 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
SDSP20132 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.3 ms