Protein–RNA interactions for Protein: P16619

CCL3L1, C-C motif chemokine 3-like 1, humanhuman

Predictions only

Length 93 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCL3L1P16619 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CCL3L1P16619 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CCL3L1P16619 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CCL3L1P16619 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CCL3L1P16619 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CCL3L1P16619 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CCL3L1P16619 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CCL3L1P16619 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CCL3L1P16619 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CCL3L1P16619 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CCL3L1P16619 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CCL3L1P16619 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CCL3L1P16619 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CCL3L1P16619 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CCL3L1P16619 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CCL3L1P16619 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CCL3L1P16619 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CCL3L1P16619 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CCL3L1P16619 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CCL3L1P16619 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CCL3L1P16619 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CCL3L1P16619 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CCL3L1P16619 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CCL3L1P16619 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CCL3L1P16619 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CCL3L1P16619 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CCL3L1P16619 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CCL3L1P16619 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CCL3L1P16619 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CCL3L1P16619 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CCL3L1P16619 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CCL3L1P16619 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CCL3L1P16619 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CCL3L1P16619 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CCL3L1P16619 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
CCL3L1P16619 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CCL3L1P16619 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CCL3L1P16619 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CCL3L1P16619 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CCL3L1P16619 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CCL3L1P16619 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CCL3L1P16619 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CCL3L1P16619 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CCL3L1P16619 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CCL3L1P16619 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CCL3L1P16619 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CCL3L1P16619 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CCL3L1P16619 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
CCL3L1P16619 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CCL3L1P16619 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CCL3L1P16619 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CCL3L1P16619 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
CCL3L1P16619 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
CCL3L1P16619 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CCL3L1P16619 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CCL3L1P16619 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CCL3L1P16619 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CCL3L1P16619 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CCL3L1P16619 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CCL3L1P16619 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CCL3L1P16619 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CCL3L1P16619 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CCL3L1P16619 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CCL3L1P16619 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CCL3L1P16619 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CCL3L1P16619 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CCL3L1P16619 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CCL3L1P16619 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CCL3L1P16619 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CCL3L1P16619 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CCL3L1P16619 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CCL3L1P16619 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CCL3L1P16619 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CCL3L1P16619 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CCL3L1P16619 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CCL3L1P16619 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CCL3L1P16619 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CCL3L1P16619 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CCL3L1P16619 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CCL3L1P16619 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CCL3L1P16619 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CCL3L1P16619 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CCL3L1P16619 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CCL3L1P16619 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CCL3L1P16619 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CCL3L1P16619 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CCL3L1P16619 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CCL3L1P16619 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CCL3L1P16619 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CCL3L1P16619 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CCL3L1P16619 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CCL3L1P16619 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CCL3L1P16619 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CCL3L1P16619 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CCL3L1P16619 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CCL3L1P16619 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CCL3L1P16619 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CCL3L1P16619 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
CCL3L1P16619 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CCL3L1P16619 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.8 ms