Protein–RNA interactions for Protein: P15085

CPA1, Carboxypeptidase A1, humanhuman

Predictions only

Length 419 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CPA1P15085 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CPA1P15085 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
CPA1P15085 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CPA1P15085 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CPA1P15085 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CPA1P15085 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CPA1P15085 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CPA1P15085 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CPA1P15085 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CPA1P15085 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CPA1P15085 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CPA1P15085 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CPA1P15085 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CPA1P15085 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CPA1P15085 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CPA1P15085 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CPA1P15085 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CPA1P15085 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CPA1P15085 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CPA1P15085 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CPA1P15085 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CPA1P15085 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CPA1P15085 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.31
CPA1P15085 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CPA1P15085 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CPA1P15085 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CPA1P15085 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CPA1P15085 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CPA1P15085 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CPA1P15085 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CPA1P15085 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CPA1P15085 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CPA1P15085 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CPA1P15085 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CPA1P15085 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CPA1P15085 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CPA1P15085 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CPA1P15085 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
CPA1P15085 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CPA1P15085 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CPA1P15085 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CPA1P15085 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CPA1P15085 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
CPA1P15085 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CPA1P15085 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CPA1P15085 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CPA1P15085 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CPA1P15085 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CPA1P15085 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CPA1P15085 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CPA1P15085 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
CPA1P15085 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CPA1P15085 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CPA1P15085 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CPA1P15085 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CPA1P15085 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CPA1P15085 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CPA1P15085 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CPA1P15085 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CPA1P15085 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CPA1P15085 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
CPA1P15085 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CPA1P15085 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CPA1P15085 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CPA1P15085 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CPA1P15085 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CPA1P15085 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CPA1P15085 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CPA1P15085 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CPA1P15085 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CPA1P15085 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CPA1P15085 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CPA1P15085 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CPA1P15085 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CPA1P15085 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CPA1P15085 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CPA1P15085 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CPA1P15085 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CPA1P15085 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CPA1P15085 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
CPA1P15085 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CPA1P15085 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CPA1P15085 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
CPA1P15085 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CPA1P15085 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CPA1P15085 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CPA1P15085 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CPA1P15085 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CPA1P15085 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CPA1P15085 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CPA1P15085 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CPA1P15085 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CPA1P15085 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CPA1P15085 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CPA1P15085 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CPA1P15085 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CPA1P15085 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CPA1P15085 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CPA1P15085 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CPA1P15085 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.8 ms