Protein–RNA interactions for Protein: P13521

SCG2, Secretogranin-2, humanhuman

Predictions only

Length 617 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCG2P13521 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
SCG2P13521 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
SCG2P13521 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
SCG2P13521 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
SCG2P13521 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
SCG2P13521 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
SCG2P13521 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
SCG2P13521 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SCG2P13521 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SCG2P13521 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SCG2P13521 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SCG2P13521 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SCG2P13521 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SCG2P13521 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SCG2P13521 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SCG2P13521 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SCG2P13521 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SCG2P13521 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SCG2P13521 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SCG2P13521 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SCG2P13521 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SCG2P13521 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SCG2P13521 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SCG2P13521 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SCG2P13521 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SCG2P13521 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SCG2P13521 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SCG2P13521 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SCG2P13521 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SCG2P13521 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SCG2P13521 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SCG2P13521 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SCG2P13521 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SCG2P13521 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SCG2P13521 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SCG2P13521 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SCG2P13521 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SCG2P13521 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SCG2P13521 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SCG2P13521 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
SCG2P13521 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SCG2P13521 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SCG2P13521 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
SCG2P13521 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SCG2P13521 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SCG2P13521 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SCG2P13521 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SCG2P13521 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SCG2P13521 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SCG2P13521 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SCG2P13521 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SCG2P13521 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SCG2P13521 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SCG2P13521 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SCG2P13521 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SCG2P13521 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SCG2P13521 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SCG2P13521 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SCG2P13521 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SCG2P13521 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SCG2P13521 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SCG2P13521 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SCG2P13521 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
SCG2P13521 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SCG2P13521 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SCG2P13521 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SCG2P13521 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SCG2P13521 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SCG2P13521 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SCG2P13521 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SCG2P13521 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SCG2P13521 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SCG2P13521 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SCG2P13521 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SCG2P13521 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SCG2P13521 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SCG2P13521 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SCG2P13521 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SCG2P13521 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SCG2P13521 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SCG2P13521 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SCG2P13521 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SCG2P13521 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SCG2P13521 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SCG2P13521 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SCG2P13521 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SCG2P13521 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SCG2P13521 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SCG2P13521 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SCG2P13521 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SCG2P13521 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SCG2P13521 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SCG2P13521 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SCG2P13521 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SCG2P13521 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SCG2P13521 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SCG2P13521 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SCG2P13521 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SCG2P13521 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SCG2P13521 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.6 ms