Protein–RNA interactions for Protein: P13378

HOXD8, Homeobox protein Hox-D8, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 290 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD8P13378 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
HOXD8P13378 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
HOXD8P13378 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
HOXD8P13378 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
HOXD8P13378 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
HOXD8P13378 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
HOXD8P13378 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
HOXD8P13378 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
HOXD8P13378 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
HOXD8P13378 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
HOXD8P13378 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
HOXD8P13378 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
HOXD8P13378 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
HOXD8P13378 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
HOXD8P13378 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
HOXD8P13378 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
HOXD8P13378 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
HOXD8P13378 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
HOXD8P13378 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
HOXD8P13378 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
HOXD8P13378 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
HOXD8P13378 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
HOXD8P13378 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
HOXD8P13378 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
HOXD8P13378 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
HOXD8P13378 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
HOXD8P13378 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
HOXD8P13378 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
HOXD8P13378 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
HOXD8P13378 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
HOXD8P13378 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
HOXD8P13378 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
HOXD8P13378 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
HOXD8P13378 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
HOXD8P13378 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC21.66■■□□□ 1.06
HOXD8P13378 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
HOXD8P13378 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
HOXD8P13378 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
HOXD8P13378 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
HOXD8P13378 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
HOXD8P13378 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
HOXD8P13378 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
HOXD8P13378 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
HOXD8P13378 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
HOXD8P13378 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
HOXD8P13378 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
HOXD8P13378 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
HOXD8P13378 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
HOXD8P13378 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
HOXD8P13378 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
HOXD8P13378 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
HOXD8P13378 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
HOXD8P13378 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
HOXD8P13378 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
HOXD8P13378 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
HOXD8P13378 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
HOXD8P13378 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
HOXD8P13378 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
HOXD8P13378 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC21.65■■□□□ 1.06
HOXD8P13378 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.65■■□□□ 1.06
HOXD8P13378 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
HOXD8P13378 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
HOXD8P13378 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
HOXD8P13378 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
HOXD8P13378 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
HOXD8P13378 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
HOXD8P13378 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
HOXD8P13378 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
HOXD8P13378 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
HOXD8P13378 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
HOXD8P13378 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
HOXD8P13378 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
HOXD8P13378 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
HOXD8P13378 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
HOXD8P13378 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
HOXD8P13378 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
HOXD8P13378 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
HOXD8P13378 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
HOXD8P13378 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
HOXD8P13378 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
HOXD8P13378 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
HOXD8P13378 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
HOXD8P13378 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
HOXD8P13378 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
HOXD8P13378 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
HOXD8P13378 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
HOXD8P13378 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
HOXD8P13378 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
HOXD8P13378 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
HOXD8P13378 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
HOXD8P13378 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
HOXD8P13378 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
HOXD8P13378 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
HOXD8P13378 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
HOXD8P13378 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
HOXD8P13378 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
HOXD8P13378 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
HOXD8P13378 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
HOXD8P13378 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
HOXD8P13378 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.1 ms