Protein–RNA interactions for Protein: P12814

ACTN1, Alpha-actinin-1, humanhuman

Predictions only

Length 892 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTN1P12814 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ACTN1P12814 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ACTN1P12814 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ACTN1P12814 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ACTN1P12814 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ACTN1P12814 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ACTN1P12814 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ACTN1P12814 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ACTN1P12814 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ACTN1P12814 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
ACTN1P12814 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ACTN1P12814 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ACTN1P12814 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ACTN1P12814 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ACTN1P12814 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
ACTN1P12814 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ACTN1P12814 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ACTN1P12814 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ACTN1P12814 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ACTN1P12814 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ACTN1P12814 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ACTN1P12814 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ACTN1P12814 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ACTN1P12814 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ACTN1P12814 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ACTN1P12814 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ACTN1P12814 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ACTN1P12814 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ACTN1P12814 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ACTN1P12814 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ACTN1P12814 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ACTN1P12814 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ACTN1P12814 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ACTN1P12814 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ACTN1P12814 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ACTN1P12814 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ACTN1P12814 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ACTN1P12814 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ACTN1P12814 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ACTN1P12814 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ACTN1P12814 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ACTN1P12814 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ACTN1P12814 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ACTN1P12814 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ACTN1P12814 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ACTN1P12814 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ACTN1P12814 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ACTN1P12814 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ACTN1P12814 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ACTN1P12814 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ACTN1P12814 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
ACTN1P12814 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
ACTN1P12814 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ACTN1P12814 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ACTN1P12814 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ACTN1P12814 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ACTN1P12814 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ACTN1P12814 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
ACTN1P12814 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
ACTN1P12814 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ACTN1P12814 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ACTN1P12814 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ACTN1P12814 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ACTN1P12814 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ACTN1P12814 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ACTN1P12814 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
ACTN1P12814 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ACTN1P12814 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ACTN1P12814 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ACTN1P12814 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ACTN1P12814 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ACTN1P12814 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ACTN1P12814 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ACTN1P12814 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ACTN1P12814 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ACTN1P12814 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ACTN1P12814 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ACTN1P12814 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ACTN1P12814 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
ACTN1P12814 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ACTN1P12814 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ACTN1P12814 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ACTN1P12814 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ACTN1P12814 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ACTN1P12814 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ACTN1P12814 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ACTN1P12814 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ACTN1P12814 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
ACTN1P12814 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ACTN1P12814 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
ACTN1P12814 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ACTN1P12814 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
ACTN1P12814 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
ACTN1P12814 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
ACTN1P12814 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
ACTN1P12814 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ACTN1P12814 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
ACTN1P12814 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
ACTN1P12814 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ACTN1P12814 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.1 ms