Protein–RNA interactions for Protein: P10589

NR2F1, COUP transcription factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 423 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NR2F1P10589 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
NR2F1P10589 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
NR2F1P10589 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
NR2F1P10589 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
NR2F1P10589 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
NR2F1P10589 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
NR2F1P10589 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
NR2F1P10589 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
NR2F1P10589 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
NR2F1P10589 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
NR2F1P10589 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
NR2F1P10589 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
NR2F1P10589 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
NR2F1P10589 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
NR2F1P10589 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
NR2F1P10589 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
NR2F1P10589 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
NR2F1P10589 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
NR2F1P10589 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
NR2F1P10589 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
NR2F1P10589 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
NR2F1P10589 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
NR2F1P10589 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
NR2F1P10589 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
NR2F1P10589 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
NR2F1P10589 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
NR2F1P10589 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
NR2F1P10589 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
NR2F1P10589 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
NR2F1P10589 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
NR2F1P10589 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
NR2F1P10589 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
NR2F1P10589 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
NR2F1P10589 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
NR2F1P10589 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
NR2F1P10589 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
NR2F1P10589 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
NR2F1P10589 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
NR2F1P10589 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
NR2F1P10589 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
NR2F1P10589 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
NR2F1P10589 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
NR2F1P10589 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
NR2F1P10589 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
NR2F1P10589 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
NR2F1P10589 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
NR2F1P10589 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
NR2F1P10589 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
NR2F1P10589 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
NR2F1P10589 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
NR2F1P10589 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
NR2F1P10589 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
NR2F1P10589 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
NR2F1P10589 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
NR2F1P10589 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
NR2F1P10589 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
NR2F1P10589 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
NR2F1P10589 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.29■□□□□ 0.52
NR2F1P10589 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
NR2F1P10589 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
NR2F1P10589 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
NR2F1P10589 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
NR2F1P10589 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
NR2F1P10589 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
NR2F1P10589 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
NR2F1P10589 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
NR2F1P10589 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
NR2F1P10589 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
NR2F1P10589 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
NR2F1P10589 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
NR2F1P10589 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
NR2F1P10589 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
NR2F1P10589 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
NR2F1P10589 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
NR2F1P10589 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
NR2F1P10589 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
NR2F1P10589 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
NR2F1P10589 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
NR2F1P10589 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
NR2F1P10589 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
NR2F1P10589 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
NR2F1P10589 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
NR2F1P10589 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
NR2F1P10589 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
NR2F1P10589 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
NR2F1P10589 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
NR2F1P10589 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
NR2F1P10589 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
NR2F1P10589 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
NR2F1P10589 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
NR2F1P10589 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
NR2F1P10589 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
NR2F1P10589 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
NR2F1P10589 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
NR2F1P10589 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
NR2F1P10589 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
NR2F1P10589 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
NR2F1P10589 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
NR2F1P10589 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
NR2F1P10589 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.1 ms