Protein–RNA interactions for Protein: P10072

HKR1, Krueppel-related zinc finger protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 659 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HKR1P10072 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
HKR1P10072 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
HKR1P10072 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HKR1P10072 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
HKR1P10072 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HKR1P10072 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
HKR1P10072 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
HKR1P10072 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
HKR1P10072 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
HKR1P10072 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
HKR1P10072 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
HKR1P10072 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
HKR1P10072 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
HKR1P10072 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HKR1P10072 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HKR1P10072 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
HKR1P10072 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HKR1P10072 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HKR1P10072 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
HKR1P10072 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HKR1P10072 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HKR1P10072 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
HKR1P10072 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
HKR1P10072 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
HKR1P10072 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
HKR1P10072 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
HKR1P10072 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
HKR1P10072 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
HKR1P10072 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
HKR1P10072 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
HKR1P10072 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
HKR1P10072 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
HKR1P10072 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
HKR1P10072 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
HKR1P10072 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
HKR1P10072 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
HKR1P10072 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
HKR1P10072 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
HKR1P10072 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
HKR1P10072 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
HKR1P10072 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
HKR1P10072 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
HKR1P10072 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
HKR1P10072 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
HKR1P10072 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
HKR1P10072 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
HKR1P10072 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
HKR1P10072 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC16.55■□□□□ 0.24
HKR1P10072 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
HKR1P10072 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
HKR1P10072 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
HKR1P10072 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
HKR1P10072 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
HKR1P10072 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
HKR1P10072 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
HKR1P10072 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
HKR1P10072 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
HKR1P10072 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
HKR1P10072 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
HKR1P10072 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
HKR1P10072 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
HKR1P10072 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
HKR1P10072 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
HKR1P10072 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
HKR1P10072 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
HKR1P10072 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
HKR1P10072 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
HKR1P10072 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
HKR1P10072 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
HKR1P10072 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
HKR1P10072 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
HKR1P10072 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
HKR1P10072 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
HKR1P10072 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
HKR1P10072 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC16.54■□□□□ 0.24
HKR1P10072 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
HKR1P10072 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
HKR1P10072 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
HKR1P10072 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
HKR1P10072 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
HKR1P10072 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
HKR1P10072 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
HKR1P10072 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
HKR1P10072 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
HKR1P10072 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC16.53■□□□□ 0.24
HKR1P10072 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
HKR1P10072 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
HKR1P10072 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
HKR1P10072 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
HKR1P10072 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
HKR1P10072 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
HKR1P10072 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
HKR1P10072 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
HKR1P10072 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
HKR1P10072 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
HKR1P10072 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
HKR1P10072 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
HKR1P10072 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
HKR1P10072 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
HKR1P10072 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.7 ms