Protein–RNA interactions for Protein: P0DMB2

C8orf88, Uncharacterized protein C8orf88, humanhuman

Predictions only

Length 117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C8orf88P0DMB2 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
C8orf88P0DMB2 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
C8orf88P0DMB2 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
C8orf88P0DMB2 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
C8orf88P0DMB2 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
C8orf88P0DMB2 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
C8orf88P0DMB2 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
C8orf88P0DMB2 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
C8orf88P0DMB2 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
C8orf88P0DMB2 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
C8orf88P0DMB2 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
C8orf88P0DMB2 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
C8orf88P0DMB2 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
C8orf88P0DMB2 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
C8orf88P0DMB2 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
C8orf88P0DMB2 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
C8orf88P0DMB2 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
C8orf88P0DMB2 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
C8orf88P0DMB2 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
C8orf88P0DMB2 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
C8orf88P0DMB2 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
C8orf88P0DMB2 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
C8orf88P0DMB2 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
C8orf88P0DMB2 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
C8orf88P0DMB2 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
C8orf88P0DMB2 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
C8orf88P0DMB2 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
C8orf88P0DMB2 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
C8orf88P0DMB2 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
C8orf88P0DMB2 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
C8orf88P0DMB2 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
C8orf88P0DMB2 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
C8orf88P0DMB2 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
C8orf88P0DMB2 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
C8orf88P0DMB2 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
C8orf88P0DMB2 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
C8orf88P0DMB2 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
C8orf88P0DMB2 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
C8orf88P0DMB2 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
C8orf88P0DMB2 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
C8orf88P0DMB2 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
C8orf88P0DMB2 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
C8orf88P0DMB2 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
C8orf88P0DMB2 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
C8orf88P0DMB2 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
C8orf88P0DMB2 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
C8orf88P0DMB2 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
C8orf88P0DMB2 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
C8orf88P0DMB2 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
C8orf88P0DMB2 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
C8orf88P0DMB2 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
C8orf88P0DMB2 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
C8orf88P0DMB2 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
C8orf88P0DMB2 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
C8orf88P0DMB2 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
C8orf88P0DMB2 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
C8orf88P0DMB2 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
C8orf88P0DMB2 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
C8orf88P0DMB2 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
C8orf88P0DMB2 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
C8orf88P0DMB2 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
C8orf88P0DMB2 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
C8orf88P0DMB2 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
C8orf88P0DMB2 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
C8orf88P0DMB2 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
C8orf88P0DMB2 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
C8orf88P0DMB2 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
C8orf88P0DMB2 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
C8orf88P0DMB2 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
C8orf88P0DMB2 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
C8orf88P0DMB2 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
C8orf88P0DMB2 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
C8orf88P0DMB2 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
C8orf88P0DMB2 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
C8orf88P0DMB2 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
C8orf88P0DMB2 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
C8orf88P0DMB2 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
C8orf88P0DMB2 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
C8orf88P0DMB2 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
C8orf88P0DMB2 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
C8orf88P0DMB2 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
C8orf88P0DMB2 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
C8orf88P0DMB2 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
C8orf88P0DMB2 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
C8orf88P0DMB2 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
C8orf88P0DMB2 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
C8orf88P0DMB2 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
C8orf88P0DMB2 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
C8orf88P0DMB2 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
C8orf88P0DMB2 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
C8orf88P0DMB2 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
C8orf88P0DMB2 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
C8orf88P0DMB2 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
C8orf88P0DMB2 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
C8orf88P0DMB2 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
C8orf88P0DMB2 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
C8orf88P0DMB2 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
C8orf88P0DMB2 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
C8orf88P0DMB2 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
C8orf88P0DMB2 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.7 ms